EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01412 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:43310689-43312707 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:43310961-43310973GATTGTTTGTTC+6.02
Foxd3MA0041.1chr1:43311123-43311135GATTATTTGTTT+6.07
GRHL2MA1105.1chr1:43311756-43311771GTAAAACCAGTTTCA+6.82
IRF4MA1419.1chr1:43312532-43312547GAGTTTCGGTTTTGA-6.35
IRF8MA0652.1chr1:43312533-43312547AGTTTCGGTTTTGA-6.3
IRF9MA0653.1chr1:43312533-43312548AGTTTCGGTTTTGAT-7.21
RUNX3MA0684.1chr1:43311163-43311173AAACCGCAAA+6.02
Sox3MA0514.1chr1:43311902-43311912CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
TTTATCCTTG TTAACAAATA CAGACAGCGA TAATCATAAT AAGTTTTTTA AGTGGTGCAA 60
AGCAGCTGAA CTACAACTGA ACATTTCACA CAACTTTCAC AAAAAAAGAA AGAGATGGTA 120
ATTAACTTTA GAAAAACCTC AGAGGTGAAA CCGGTGTATT TTGGAAAACA AGTTGAAAAG 180
GGTACAGGAA TATAAGTACC TTGGTACAAT CTTTGATACC AGATTAAAGT TCTAGCAGAA 240
CTCAGAAACT GTTGCTAAAA AAGTGTATCA GAGATTGTTT GTTCTTAGGA AACTGAACTC 300
CTTCTGTGTA GATAAAAAAC ATATACTGAG AACTTTTTAT ACAACCTATA TTGAGAGTAT 360
ATCAAGCTTT TCCTTTTATG CTGGTTCTCC TCACTTTTCG TTGCGATTCA AAACTTAATC 420
AAGACTTGCG CCAAGATTAT TTGTTTCTCT CTGCGCAGTC TAGCAGAGTC ACATAAACCG 480
CAAATGCTAA AAAAACCTCA AACATTTACA TTTAGTCATT TAGTAGACGC TTTTATCCAA 540
AGCGACTTAC AAATGAGGAC AAGGAAGCAT TTTACACAAC TATAAGAGCA ACAATGAATA 600
AGTTCTGTAG GCAAGTTTCA GGTATGTAAA GAAAGTGTAA GAAGCAAAAC ATTAGTCATT 660
ATTTTTATTT TTTTAAAGTG TGATAGGAGA TGATTCCCAT CCTCTGAAGC CTTTTTTTGT 720
TCTCTTGCCC TCTGGAAGAA GGTTTAGAAG CATCAGATGC TCTTCTAACA AATATAAATT 780
CACCTTTGTT CCTGAGGTAA TAAAGCTTTA CAACATTACA TTTTAGCAAG TTTAAAATGT 840
TTAATATATG GGTCTTTCCT ATGTTTTCAG TACTATTTAT GAAGTTATTA TGAAGCATGC 900
TAGATTGTGT TTTTTAATAC TTTTTTGTGA GTGATTTGTT TTTTTTAATG TGTTTGTTGT 960
ATCATGAAAT GCTACTACCC TAATCTAATT GCCAGTGGTG GGATTAATAA AGTTGTTAAA 1020
TTTAAACTTT GAAGTAGCTT ATTTTGCCCA CTATGTCTGA CTTATAAGTA AAACCAGTTT 1080
CACAACAGCA GATTTTCAGT CAGTTGCTTT ACATATGAAA GAATCGGGTG TTAAAAGGCC 1140
CAATGACTGG ACTCCTTAAT GGCCCTATTG ACTTTAAAAC AAATTCCAGC ATGTTGAAGC 1200
GTTGATCAAG CACCCTTTGT TTTAATTGAG AGAGAAACCA TCTGTCTTGA TTGAAAGTAT 1260
GCAACTGTTT GTAGTTGAAA GGCTTTTCTA TGTCTGTAGA CGTCACTTAT AATGCCTATA 1320
GTACCCGAGA CTGGATTTAT TTGATCAAAA ATGCAACAGA AACAGTAATA TTGTGAAATA 1380
TTGCAATTGA AACTAATGGT TTCCGTTTCA ATGCATTGTA AATGGTCTTT TTTGTCTGTG 1440
ATGTCAAAGC TGAATGTTCA GCAACATTAT ACTTCAGAGT CACACGGTCC TTCAGAAATC 1500
ATTCTAAGAT GATTATATGA TGCACAATCA TATTAATCCT TAAATGATCA AAGTTGAGAA 1560
CATTTTGGTG CTTAATATTC TGTGCAATCG CTCTTCATTT TATCTTACCA ACTCCAACTT 1620
TTGAATGGTA ATATATATGA TGTAGGAATT AGTGGATCTA ACCAATTACA TGAAGTATTT 1680
TCCAACACCA CAACTTCTAT TACAACTTTG AAGGATTTAT AAAAACTGTA TGTATCTGCT 1740
TTTTTTTAAT ACTGTGAGTA TGAAGTGCTG TGTGAGGTCT TAAAACTCAT TTTTAATATC 1800
ACTACTAGAG AGAGACAGCC TTTAAATTCA GGTTTAAACT AAAGAGTTTC GGTTTTGATG 1860
GCCATTTTTT TCCTTTCCAT GTGATTAATA CAAGCAAAAT ACAAAATGAC AAGCAACTTA 1920
TGTAAATTGA TTACTTTATG GTAAACACAT GAAATTCCCT ACAATTTTAA GGATTGAACA 1980
GTTATCTGGT TCAATTAGCG TCACAGATTG CAACCTAA 2018