EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01380 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:41587574-41588530 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:41587711-41587722TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:41587708-41587719ATTTTAATTAA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
CATTCTTCAA CGCCATGTCT TAAAAATGTC AATTTATTTT AACCACAATA TTTTATATGA 60
AGTTTTAGCA CTCGTCTGCA TGTGTTTTAC GTTTGAACAA CTAAATGATT GCTTCAGCTT 120
ATTTAAAGGA TATTATTTTA ATTAAATTAC ATTATCGTTG ATGTAAAAGG CACTTTATGA 180
ATATGGAAAG TCACATTAAG TTAACCCCTG CGCTGGACGT TTATCGGTGG CTGATAAACA 240
CTTGCTGTGA ATATAAGTTA GCCTATTAAG TGCATTATAA CCCCAAAGAC ATAATTACAG 300
CATCTCACGT AAAAAAATAA AGAACTATAA ATGGACGCCC TTTACGTTAA AAGTTAATGT 360
TACGCCAGTA TGGGCACACA TTCGACAACC TCCTAAGACA GTCAGTAGTG CCCTAACGCT 420
AGACCAAATC GTTCTATAAC AAAATCAGTA TGTTACTGTC CGTTCACAAC TATCTAAACG 480
CATGCTTAAT GTTAACCACA GTAAAAGCCA CGGTAAATTC ACAAAGGACT GAGCTAACGT 540
TAGCAACGAA GCTTTTTTCG TTTGGAATGG CGGATCACGG ACACTGTCGT CACATCAAAG 600
AAAATGCTTA TTCTCTTGAA AATAGCCATT TACTTCATTA AAAAACATTA TATATCAAGT 660
CTACATAACT ACATTCTTGC TAAAAAGAAT ATTTAATATA TTCTGCGACA TAAAAACGAG 720
ATTTGTCAAA CCGTGTGTAA CGTTAACTGT TAGCTTAACT TGCGAGCGCG CTCGAAGGCT 780
GGTCGCTGTC AAATTTAAAA ACGACCAAAA TAGACAGTCC GAACGAGAGA CCATTTTATG 840
CGTTTATGTT ACCCACAAAG TTTTCTTTAA TAAACAGTCT GGTACAATAT AAAATGTGAC 900
TTACTGTGCA AATGGATGTA CAGAAATCCG GCTCTGGCGT CTTGCTTCCA TCTGAC 956