EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01350 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:40813909-40815339 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Rarg(var.2)MA0860.1chr1:40814833-40814850ATGGTCACTGGAGGTCA+6.42
TEAD1MA0090.2chr1:40815324-40815334CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr1:40815324-40815334CACATTCCAT+6.02
Enhancer Sequence
TTCAATGTTA GTGACATATT TCACAAACAA CCAGAATGCA CACAAAGACT TGTGGTAGGA 60
AACCTTTGCT AACTGAAACA GGAAAAACAG ACTTTATCGC TTCTAATCAC CAGTATATAA 120
AGTAAAGCCT TCATCTGTGT CAGCTACACT CGTGTATTAG TGTGTTCATG TTTTTTTCCC 180
TCCCCTGTGT GGGAGTGTGT TTCTCACGTT TCTCACACTG CTAAATCAAC CATGTCTGCA 240
CTGTTTGATG ACCATCTGGG GACAGAATGG TCTTATTCGT TCCCTCCCCT CCCTTTTTTT 300
ATGCCTATAG CCGTTTCTGT GGCTTTTCCC GCACCTCTCA ATGGTGATTT CGTGTTCACG 360
CTGGGTTTCT CCAGCAACCT TTGTTGACAC GACATGGGCT GGTCTGCATT AGCAACACAA 420
TGCTGTCTCG CTAAAGCATC TGACATGGTG GAGAGTGTGG GCATGTCTAT GTTAGGAAGA 480
AGTTGGGGTA ACCAGCAAAA GGTTTTGACA TGGACTCTTG TAATGATTGG GTCCCAGTGT 540
TTTCTAAAGC ATTAAACATG ACTTTTGGTC AGGAGTGGGC AGGGTGGTGG TGGTGGTAGC 600
AGCATTTAGC TACAGCTGAG ATTAAACTGC ATGATCAGAA ATGCATATAT TCACTCGTAT 660
GCAGCTAGTA TTAATGATAG CTGTACTATA TATATTTATC AATAGTTTTT TACAAGGCTA 720
TATTTTGCTA AAGCAAATAC AAAATGAAAC TATCATCTAA CACAGGAGCT ACTCTTCAAA 780
TGCAGGAGAA CTTTGCAAGT GTGTTGCACT TTCAAATGGT ATGATCTGTT TTAGACTTCG 840
AGCCATCTGG AGACATGGAG CAACAGTTGT TGAGCATGTG TTGAGAGAAA ACAAAGAGAC 900
AAGTCTGTGT TAGAGGCAAG ATCAATGGTC ACTGGAGGTC AAAAGCTTCC CCATTGGCCT 960
TGCTCAAACA CCCATCTACT CTCCCATGTC AGACACTCCT GTTTTTTTCA ATGGGAAACA 1020
AAGCAGGCAT ATAAATAACA GCTACTGCAG CAGCGTTGAT CATTTGATGA GATGCATTAG 1080
CAATTTGTCA TGTCATCATT TTAAGTAAGC GCTCAACAAG TCCTCCTTTT ACCACATAAC 1140
CACTTCAGCT TATTTGGTTC AGTTTTTGCT TTCGTGAGAA AATGTTGCAT GTAGGCGTGC 1200
CTTAAACGGA ACTTCCATTC AGTGTGGAGG TATACATGAG TTTGTCAGCC TTGTTCACCT 1260
GTTTATTTGC TCCATTTACA TTAGAAACTG AGATTAATGA GGGATTAAAT TGGTTTATCT 1320
ATCCAGTTAA GCAAGGGGAT GTTACTAAAT CCAGGTTTTG ATCTGAAATT TTTTGAGCTT 1380
GTCCACTTTT GACAACATCT ATTGGTAGTC ATATACACAT TCCATCAGAT 1430