EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01337 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:40488561-40489537 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:40489150-40489163ATAACCACTTAAC+6.87
Sox3MA0514.1chr1:40489118-40489128AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:40488631-40488643AAAAAAAAAAAA+6.22
mix-aMA0621.1chr1:40489492-40489503CCTAATTAATT-6.32
Enhancer Sequence
GATGGGGCAA CACTGAGTCA AAAATATGAT GGTATTGACT TGTTTAAGTT TAGTTTGTGG 60
GACAGAACCC AAAAAAAAAA AAGCTTTCTA GATTTAAGCA TTCTTATATT GTAGTTTCAG 120
ACCAAGACAA AAAAAAATCA TATACAGCTC ATGTAACAAC TAGCTAAAGA CAACTAGCTT 180
CATTTTCTTT AACACTTAAC ATTTAAAACT TAGCTACATT TCAATTCTGG TGCTAAAACA 240
GCTCGAGTCC AAGTGAATTG CGACATCTTG ACACGTGTAT TAACTGTGTC ATTCCAATAT 300
TCCACATAAC GAACATGCCA ATATCCTACA TGCCATCATG AGGTAAAAAA AACGTGACAG 360
CGCTACATGA CAGGACTTCA AACATGGTAA GTACGTTTAT CAAACAAAAC GGCTATTTTG 420
AAACACTTTA TTCACCCCAA CACTTAAAAG AACAGCGTAG AAACTTTTCC CAAGCAGAAT 480
TTATAGGATT TACCTGCTAC CGGCGAAGGT TTCCGAAGAA TCACCCATCT GTTTTTCCAC 540
TGTTAACGTA AGGAAACAAA ACAAAGGCAG AGTTCGAACA TGGAAACAAA TAACCACTTA 600
ACTTTTGGCA CAGCAATGAA TGATGCAGTA AAAGTAGTTT GCGTTGCTTT TAACCACCTT 660
TTTGCCTTCT CGGAGTTTGA CTTGTCCCTC TACGACAACC GTATCCGTCA TCTTGTGTCA 720
TGTTTCCCGA CAGCTGTGTG CGGTCCGCGG CAGTGAGTGA GTGAGGGGGT CACTTTCAAA 780
ATAACCTCCA GAATTCACTG TCTGCTCTGC TGTAACACAC ACGCAAACTC TCTCTCCCCC 840
ACAATACTCA CACATGCACA GGGCCACCCT CTCTGAACAC ACACCAGAAC GGTTTTTACA 900
GTTGTCCATT CAAGGTGACA AGTTATATGC TCCTAATTAA TTTACAACAC ATGACCTGGC 960
CATTCTGGCA AGTCTC 976