EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01294 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:39554752-39555449 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:39554858-39554869TTTTATTGCTT-6.32
HOXD9MA0913.2chr1:39554857-39554867GTTTTATTGC-6.02
SOX10MA0442.2chr1:39554787-39554798AAAACAAAGAC+6.14
Enhancer Sequence
TAGCTATTGA CGAAAGAGAA AGTCAGTTTG TTTTAAAAAC AAAGACACAT TATGATAGTA 60
GATGACGGAT GTAAAATGAT GTAAAACCTA CCTTAAAAGC TAATTGTTTT ATTGCTTACA 120
GAAAAACACA CAAACATACG CAAAACAAGA TCTTTTTGTG ACTACACATG CTGGAGCATT 180
TCAAATTCAC AACCCAGTTC CCGAAGAAAA ATGTTACAGT AAGCAGGAAC TGCAGGGTCA 240
CATATCAAAC AACATGGATA AACAGAGCAG TTTCAAGTCA TTTTAATATG AAACAGCAAC 300
CCTGGCGATT ATGGTAATAG TTTAAAATTA TTTTAAAACA TTTTTAGGAC GCAACTCAAA 360
CTTACACGAA AGGACATTTA CTCCCATTAT AAAGTTGTGA ACCGCCATGG TTGTAGTAAC 420
CGTGTTTCTC CTCTTGGGGT CACTTTAGCA TTCGGGATCA TTTATGCCGA TGAATTCCTC 480
CTCACACATC AACAATTTTC TGAAAAACTA TGCCTTTTAT CACAGAACAA GCCGAAAAGA 540
ATATGCAGTA AAGGGAACGT TGGGTGGATG GACATGCCTT GATGCCAGAT ATCAGAGGAA 600
AAGGGCAAGA CTAGTTCAAA CTCCTACAAA ACAACAGTGA CCACTACTCG CAAGCTCTGC 660
AGAGGTGAAC GCCAAACACT ATACAAGATT TCCAAAG 697