EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01277 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:39272362-39273392 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:39272660-39272675AATGTTTGTTTAATA-6.35
Foxd3MA0041.1chr1:39272659-39272671AAATGTTTGTTT+6.27
HNF1AMA0046.2chr1:39272725-39272740AGTTAATGTTTAACT+6.26
HNF1AMA0046.2chr1:39272725-39272740AGTTAATGTTTAACT-6.58
HNF1BMA0153.2chr1:39272726-39272739GTTAATGTTTAAC-6.15
Enhancer Sequence
GTTTACAGCT GTAATTTCAG AACACACACG AATTATGGGC AGGCATGAAA TTTGATCTCT 60
TCAACATGTT CAGACCCTGT AATTTACTAA ATATGGAATG TTTACGCCCC TGCATTATGC 120
AAGTATAAAA CAGCAACCAT AAGCTTTTCA AACGCAAAGG ACCAACAACA AAGAAACACG 180
TTTGGCATTA AAAATCAGTT TTTAGTGACG GAACACAAAA AGTAAGTGCT GTATTTAATC 240
TTTTAAACAA ATATATGAAT TCACTGTAGA CTACATCATC ATAAAATGTC CTTTAACAAA 300
TGTTTGTTTA ATAGCAATGT GGTGGATTGT GGTATTTTAT TCTTTGATTA AATAAACCAT 360
TAAAGTTAAT GTTTAACTAC ACATTTGTGT CTTAATGAAA GTATAGTCCA TGTTCAACAT 420
TGCAAAGAGT TTAATGAGAC GATGATGGCG TTGAGATGCT TCATGTCATT TGACCTGGCT 480
TTAATATTCT CTGATTAAGG TGAAGACATG ATACGCTTCA ACATTTTACC CCTTCTGGCA 540
TTCCTGCTCA GTTGCCATGT GCTCTTCTGT GGATCAGGCT CAGGTCTGGC ATATGCTTCA 600
AACAGTGATT CCCTTCAGGC CGTATGCAGA ATGCAGCCTA ACACTCGACT AGAGCCTGGC 660
ATGCCTCGTG TGTATGGTCA CATTTTATTC AGACAGTCTG GCCCAAAGGA AAAGCTGAGC 720
GTGACTTTCA GGCTCTATGG TCTCCCTGCG GACAGTCAGC AGCCCAGAGC CATGCACATT 780
CATGAGTATG GAGACTTAAG CAGGGGCTGC GACTCTACAG GTGGGCATTA CAATCCCCTC 840
AACGTCAACC ATCCACAACA TCCAGGGGAC TTTGGCAACT TTGTGCCCGT TAACAAGAAG 900
ATTCGGCAGT CACTGGAATC CCCTGCAACT CTCTTTGGGA AACTTTCAAT AGTCGGCCGG 960
TCTGTTGTCA TTCATGAGGG AAAGGATGAT TTGGGCAGAG GTGGGAATGT GGGAAGCTTG 1020
CTGAATGGCA 1030