EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01275 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:39258106-39259399 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD13MA0909.2chr1:39258493-39258504GTTTTATTGCG-6.32
HOXD9MA0913.2chr1:39258493-39258503GTTTTATTGC-6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr1:39259340-39259357GAGGCCATGAGAGGTCA+6.66
Enhancer Sequence
TCTCGAAGCC CCGCGGTGGT TTGAGGGCCC TCCGCGTCCA GCCTTCCCTC AGGACCTCCA 60
GGTGATCCTC CTTGCCTTGA ATGAGCAGGA CGTGTTCGTC TATCCAGCCC AAGAAGAAGG 120
TCTCCGATAT GGCGTCCGTG ACTTTCTTGT TCCAGAAGTG CTGCATGTTC TCCGCTTTGA 180
AGTCGGCGAA TATCTCGTAG CCGGTGTGAT GGTGCTGAAG CTTCTCGGTG ACCGCGGCGG 240
CCGCCTCCTC CCCGCTGACC CGCGACAGCA CGATGGCCAG GGAATGAGGC GCGATCTGCA 300
GGAACTTCTC CATTCTCCGG CGCGTTTCAC ACACAGGCCA CAGCGGGGAT CGCGACCCTG 360
TCCGACGCTC CGCGGCACTC ACACGGCGTT TTATTGCGCA CCTTATTGAA CTGCCAAAAC 420
GAACACATTG CAACGTATTT CAGTTTGTTT CCAGGAGCCG AAGCGCAGCG CGTGACGGCG 480
GAGGGTCCAC CAGCATGATA CGCAAGACAG AGACGCCAAT GTCATTTATT CATCAAAAAC 540
ACGCGTTCCG TGCGGTGAGC CCATAGCCCG ATGCCAGCGC TCCGGTGGGC AATGTTAACC 600
AGGCGCTGCG CTGATGGGCA GAGCGGCTGA GCTGAATGAC CAATGCCTCT GCTCTGCTCA 660
GCCTGTCTGT TTTAATAGAC CTCAACCTGC CGCTTCACAC ACCTCTCCCG CGACATTCTG 720
CACACACAGC CGAAAGCGAA CGACACCGAT TCCTCCAGCA CCGGGGCCTC TTGATCGATC 780
ACTGCATTCA TCGGTGATGA TCGCTGGACG TTCCGCGCAT AAAACGACTT CATCCCTTCT 840
TATTCATGTC TTCGCTTTTT TGGTGCACTC CGAGGTTGCC TCCCAGTCGG TCTCGTACAC 900
TGCATGTACG CCGTCGGTGC GCTTTCTGCT GTCCCGCTGA CCGCGCTCTG TGAACTCGTC 960
TCCGGAGGCG TCGGGCTCTC GACTCTGACG CCGTGCGCCT GGTGTCCGGT GCGCCGGATT 1020
ATGGTCTGGA CGTGTCGACG GAGAGCGCGC GGATCACCAG ATGTTTTCCT GACTCCACCT 1080
ACAGGCGGCC TTCAAAACAT CGCGAGTACA GTCAGTACAA GAGCCTCCTT GCAACAGGTG 1140
AACATGGGAG AATGGGGAGA GCAGAGAGAG CCGGCGGTCA CAGAGCAGTT TTCAGCACTT 1200
TTCAGGGAAG GAGAATGATT GGGTGGACCA TAAAGAGGCC ATGAGAGGTC AGGCTTTGTC 1260
TGTGTTTTGT TTAACCGGTT CATTCCCTTT GCA 1293