EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01270 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:39153755-39155397 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr1:39154940-39154957TGACCTTTTAGTGACAT-6.13
Rarb(var.2)MA0858.1chr1:39154940-39154957TGACCTTTTAGTGACAT-6.07
Enhancer Sequence
TGTACATATT CCAGTCTGTT CTGTTAATTC AGTTTTTTAT TAGGTACTTG TTGAATCGAC 60
ACGCAAGGCA CATTTTCCCA TTTCTGGATA AACCAATTAC AGCTAAAATG TAAATGCTCA 120
TATGCAACTT GTACATAGAA GTACAACAAT CTGGTGGTGT GTACAATACA AACAATACTC 180
ATGATTTCAA AATTTAAACC TGCTCTACGC TGAGTCTTAC ATATGTGTAA AAGTTCAAGT 240
ATACTTAAGT TTTAACATTC TTAGTTGCAT ATTTGTAGTG CCAGTGTCAT TTATTTACCC 300
ATTTACTTTT AAAGTTAAAC CATACTCTAA AGCAAGGGTG CCCAAACTTT TCCTTATTAA 360
GGGCCAAAAT CCAAACTTGA TGAAGGGCTG TGAGCCAAAA GTAAAAACAC CAAATTGTAC 420
GACGTTCAAT TTTCTATGAA TAATTTCTTA ATTTATTTCC TAATATTTGA AAAATGACTA 480
CAAAACATTG CTTTAAAATT ATATTAACTA ATGCCAAATT GTAAAATTTT TATAATGAAA 540
TGATTACAGT AAAAGCATGA TCCCATTTAC AACACAGTGG AGTTCAATGC TCAATATACT 600
TAGCTGCACA TGCCTTTGAT TTGATTTGAT TTGCTCCCTG ACGTCCTATG CATTGCCATC 660
CGTCTGGTAA AATTATTTAC ATTGTAAAAT GTCAGATTCA TTTACAAAAT AAATTTACAT 720
TAAATTTGAA ATGACGATTA ATGTCAGAGA TATTCGCCCT AACCAATCCT CTCCATCATT 780
CTCCCCATCT TCTCAAATGG GATAATGGGT CAAATCAAAG ATTTTCATGG TCCAACTTTG 840
GCCTAGGGGC TCTAGTTTGG GCATGTCTGC TCTAAAGGCA TGGTCGGGTC AGCTTAAAGA 900
CCTTTTATGC AATTAAACTG CGTAAATGCT CTTGAAAAAA AGCACACCCC AATAGAGCCA 960
TTAACACTGT GTATGCTTTC TTTCCCCGTC ACCCCAGTGT GAAATTGACT GACCAAAAGG 1020
TGTGAGCTTT AAGGCCTTTT CACAGAGTGA TTAAACTGCA TAAATGTGTG ACAATGCTGT 1080
TGTATCAAAA TAATGCATCC CTATAGAGCT ATTTATACCA TGTATGATGA ATGACTGCAT 1140
GACAAAGCAG TGTCCAGCAG TGAAATGGGC TGTCCCAATT TCATTTGACC TTTTAGTGAC 1200
ATATCCCGGA TATGCCATTT TTGCATGTAG ATTGGTGGTA GCACTAAAAG CGTCAACTAA 1260
TGGGCAATTT CTAGCATCAC TATTGGCGAG TATTTGAAAC CATAAACTGA CAGGATACAA 1320
TATTTAAGTA TGCCTGCTAG CTTTGCTTAA CGCTTCAAAC CCAAAGTGCT ACAAAAGCAA 1380
GCATCACTGT TTAGAGCATT GCAGAAGAAA TGAAACAGCT AGCAGTATGT TGATTTTTGA 1440
GACTGGGCTA TTTCAGACTG GGCCAACCAG ACAGTAAAAC AGAGGGTTAA ACAAGTTTAA 1500
CAACTTTAGC ACGAGTAACT ACATAAAACA TTTAAAGAAG TGTCACCCTA CTGAACAGTA 1560
GTTTCACAAA GGCTAGTGCA CAGAAGGCAA TGATCAATGA CAGAATCTAC AAAGTGTGAA 1620
TGGATTATTC AAATGAAGCA AA 1642