EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01259 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:38860018-38861152 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr1:38860967-38860982GGGTGCAAAGGTCAG+6.83
HNF4GMA0484.1chr1:38860966-38860981TGGGTGCAAAGGTCA+6.3
RXRBMA0855.1chr1:38860967-38860981GGGTGCAAAGGTCA+6.02
RxraMA0512.2chr1:38860967-38860981GGGTGCAAAGGTCA+6.11
Enhancer Sequence
GCAAGGTTGG GTTTGGTTTG TTTTAGTTAA CAGTAATAAC CCTGCAAATA AATCATCACA 60
TGAAGAAATA GCTATGATAA TTATGTCTTT TGTTTATTGA TTTGCTTGGT TGTGTGGATG 120
TAGCCATGTG GCATTGTGGA AAGGAAGTGG GAGCGGGTAG ATAGCAAGAT CAATAGCCAA 180
GCATTCTAGA TGTGCACATA TTCTCTTCTT GCCTATCTTT TTCACTGCAA GCATGAAAGC 240
CTTTGTCCCC ACTTATTTCC AAGCTCCTTT TCTTTTTCCA TCTTCAACAA GCACTGGAGT 300
TTTTTAACGG CATGAAATTG CCAGCTAGCA CAATGCCCTT GGTGTAAAGA GACGTAATCA 360
GCGTCACTCA CGAGTCTCTC TTAAACTTTA TTTAACGAGT CATTCATCTT TGTTTTGTCT 420
CCAAAAACAA GCTTGTGAAA GAAGGTGCTG CTTAACAGCA CATGAAACGG TGCCATAAAA 480
AGGCTGAAAG CAAATGACGA TCAGCCACTT TCTCTTCTTC TCACTCTTTT ACACAGATGT 540
GTCACTTGTA ATGCTTTCTG TCCTTCTCTC AACTGAGCCT AATTGTTCTT TCGATAGTTT 600
TGTTCGGTTC AGATTTTTCC TGACCTCTCC GATCAACCCT TCACCTCTAG AGGTTCAGGT 660
CTTTCACCAT GGCTTAACTA CTTGAACCAT TTGATCTCCC CATGCATCTT CTTTCATAGT 720
GTCCATGTCT TAGGAAGCCT TGGGCTGGCT TTGTATTATA CGGTGTGCTT TTGAAATGGG 780
AGTTATTTAA GTCAATTGTT ATGCAAGTCT ATACAACATA AAACAGTTAG AAGAAACTGT 840
TGCTATTGGC AGGTTGAGGT TATTTTTCTA GTCTGCTGGG GTGTGAGTGG GTCTGAACCC 900
TCCCGAGGAG GCGGTTTGCA TGCTGCACTG GAGAGGAGAT TGGATTTGTG GGTGCAAAGG 960
TCAGTGTGTG GGGGTTGTGG CCTGTGGACC AAGCTGACCT CTGAAACTTT CATCATCCTA 1020
CTCATTTCAC ATTTCGAACA TCTATCTGTT CTCGTTTTCT ATTTATCTTT CTTTTTTTAT 1080
CTTAAAGTAT CTTTCTTTCT ATCAATCCAT CTATCCATCT TTATCTGCCC TTCT 1134