EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01258 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:38858328-38859609 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:38859326-38859337TCTGATTGGTC-6.14
PBX1MA0070.1chr1:38859249-38859261TTTGATTGATGA-6.74
TBX20MA0689.1chr1:38859317-38859328CTTCACACCTC-6.02
Enhancer Sequence
TTGGGGGCTC AGTGGCCAGA ACTGAGATCC AGGCCAGATG CGTGGGCACG CAACACCCGC 60
CGTTCCATCT GACGCCCAGC ATCAGCCCTC GCTCTCAGTC TTTGCCACAG GCACTCCACG 120
GGGAAGTGTA CATATTTTTT TGGCGTCATC GGTGGGATGA AAGCCTTGCT TCTAAAGACG 180
GAAGAAGCAT CCTGCTGATG TCCTAGTGCC TTCCATCCCT CTTTGTTCAT CTCTGGCCAG 240
ATGTGTTGTC TCCCTGTTGT TGGTCTGGGT GTATAAGACA GGTCTCCTTT TGTTTGCTGC 300
CCAATCCGCC ATCTCTCCCT TTCTCCCGGT TTTGCAGCTC TCAGCTGGTG CCATTTGAAC 360
ATCTGCTCCC AGAGAACAGC CACCAACAAT TCAATAATGA GACAACATTT TCCTGAAAAG 420
CCACTGTGGC AAAATGCAAA AAAATAGAAG GCTCTCTCAC ACCTCCGAGG GAGTTGTGCC 480
AGCCAGCTGA GATTGACCCT GAGGGGGCTT GACTGTACGG ATAAGCCTCT GGCCTCCTAT 540
AAAGCTATCT GACACCTTCA ACTGACCCAG TTTAGATTGC AATACTATTA CCCGTCCATT 600
CACCAAACTA ATCCGGCTTA TTAAATCTTC TCTCTAAGCC CGTGTGTTCA TTGCAGCCAA 660
TTAAAAGTGA ATGTTTGGAG TTTGTTTAGC TGGTGAGATT GATGTATTTA TAGATGTGTA 720
AATGAATGTG TATTTTCAGT GGTAGACACC ACAAAAGCTC TCTTCAGTAA GTGATTGTAA 780
TGTATGGGCT CAAACGCAGC TTTTTGATAT GCTTTATTAG AGAAAGATGG AAGGGAGCTA 840
ACGGAAGTTG AAAGCCTAAT TTGTTTCCTG GTTTTCAGTT CTGCGCTCAG GGACCAGATT 900
TCTCCTCCAT ATACAATGAT TTTTGATTGA TGAATTCCCT TGACACCTAA GCTGCACCAT 960
CTCCCGGCCT GTTGTCCCAT GGTGACCGTC TTCACACCTC TGATTGGTCC CTAGATGTGG 1020
TCTCCTGCGG TAACTGTGCA GGCCGCGTGG CAGGTGTGCT GCTGGTGTTG GCTGGTGGCG 1080
AGCCCCTTCG CTGATTTTGT TATCACATGG GATGAGGATA ATGAAAGACT TGGGTGTTTG 1140
TGTATGTGTA TGTGTGTGTG TGAGATTACA TCCTCCGAGA GGCCTACGCC TGCTATTTTG 1200
CCCAGGAGGT AGCACCGGCA GTGCTGGTTG GCTTAATGCT GAGAGATTAG GCCTCTCCGA 1260
AGAGGTAATT GCTCACAGCA C 1281