EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01002 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:29089697-29091035 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:29091014-29091026AAACAAACATTT-6.27
Foxq1MA0040.1chr1:29090651-29090662AATAAACAATT-6.02
IRF7MA0772.1chr1:29090856-29090870CCTAAAACGAAAAT+6.09
Nkx3-2MA0122.3chr1:29089740-29089753TAAAACACTTAAA+6.33
ZNF263MA0528.1chr1:29090071-29090092CTCCCCCGTCACCCCTCCTCC-6.73
Enhancer Sequence
AACATTTTAT TAGAACAAAT TATTTTGCCA ATAGAATAGC ATATAAAACA CTTAAAAGCA 60
TAGTTCACCC CAAAACTTTT GTGATCATTT ACTTATCCTA CACTTGTTCC AAACCTGTTT 120
GTGTTGTTTT CTTACGTTAA ACACAAAGCA GTCATTGACT TTCATGGTAT TTTTTAATAC 180
CTGCTATGGA TGTCAATGAT ATCTCCCAAC ATTTTTCAAA ATATCTTGAT TTGTGTTCAG 240
CAAAAAAAAG ACGTTCGTAA AGGTTTCAAA TCACTTGAGT GTGAGTGAAC TAACTCTTTA 300
CCCTCAACAG AGCTAAATAT TATCTATTTA GAACTTTTTT TGCAAGTCCT CCTGCTGTCT 360
GTAATCCTCT GCCCCTCCCC CGTCACCCCT CCTCCTGCAT GCTGTTTAAA TAGCCTTTAA 420
TGGTCGCTGT AGTGGCTGTT TTGACACTTC CTGCGCTGAT AGGGCTCTAT AAAGCAAAGA 480
TGTGCCGCAT GACACTCCGA TTGTATGGGC ATTACCATCT GTGAACACCT CCTCAACGAC 540
CCTGATAACA TCAGCACAGT GATCACAGTC TGACTCTCAC ACACACACGC AAAATCTCTC 600
CTTTAGTCCC TTCTGCTGGA TTTGTCACCT CGGCTTCACT CCATTTAATG CTAGTGTAGA 660
TCTCTGCTGT TAATGTATTT TGACATCTAG TGAGAAAGGA CATTTTAGTA GTTGCTTCAC 720
TATTTCGGTA ATGGTTTGTA AACAGTTATT TTGTCGCTGT TTGAGACCTT CGCAGTTGTG 780
TAATTGCAAC AATTGTTTTA AGCAATTAAA TATGACCTAC TTGTCACTAA ATGTGTTGCA 840
GCTACATATA ATAACAGCTC ACACTCTGAA ACCATAACAG CGGCAGTTTT GATAGAGCGA 900
TTTGTCCTAT AATCAAAATC TCGATTAACT GAACGTTTTA ACTCGATTAC GATTAATAAA 960
CAATTATTTT ATTCTTATTT TTTTGCTCTC ATAGTTCACT GATAATACAG TAAATATGCT 1020
CACATATTAC AAATCAGAGA TTTTGAATTA AGTTTGCAAT CCTTGATTTT CAAATAATTG 1080
AAGGAAACAC ACACTATCTA CTATCTATGA TTATTTATTA AACATCAACG TTGAACAACT 1140
GAATTTAAAA CACACGTTGC CTAAAACGAA AATAAACTTG CACTTTTGGT AACAATTTAT 1200
TGTTTTCAAT GTTTTTCTCA TTAAAGGTAG AAAATAAGCA GTATCTCTTC TAAATAAAAT 1260
AACTCTTGTA AATCCTGTAA ATAATATTTC AAACAGGATA TTTCCTACAT CTTCTGTAAA 1320
CAAACATTTT AATGTAAA 1338