EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00973 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:28411626-28413096 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:28412789-28412801AAACAAACAAAC-6.32
HNF1AMA0046.2chr1:28411750-28411765TGTTAATAATTAAAC+6.05
HNF1BMA0153.2chr1:28411751-28411764GTTAATAATTAAA+6.24
Enhancer Sequence
TCTGGCCGCG CGCGGTAAAC AACCCAACTG CGCATACACT ATGACGCTGC AGGAAATCAC 60
GGCGCGCGCG CTTGTTTATT TCCAACATAC ATGAATCGCA GCTTGCTTTT TGCTGATTGA 120
GGCGTGTTAA TAATTAAACC TTTTAATGCT TGTAAAAAGC GGATATAATA AGTTGAACGG 180
TTTCGGGCAT GGAATATTGT GAACTGTGGC GAGGGAATGT TGTTTTGAGG TTTATTTGGC 240
TTAAATGTGA AGCAGTGTTT TCTGCACATT CCAAGAAATA AATCTTCGAT GTAAGGCAGA 300
TTTCTCATAA TATTCTGATT TCCTGTATTA GTACGCATCG ACTGGTAATT CCCATTAATG 360
GGCATGGTAA TTTGCAGTTA AATTATTAAA ATATGTGTCA CGTGTTGGCA AGAGTGAACA 420
TTGTCTTGCA AGAGTGCATG CGTTAATTTG GCTACTTGAA TTTTATGTGA GCGTGAGATC 480
AAACTGCTGT CACGAGCAGG AACGGTATGC TGCGCCTAAT ATAGTGCAGC GCCTGGGGCT 540
TTTTCCTGTG CACGCAGTTT TTGCATATCA CCCAGAAAAA CAACATGCCA TGTTAAGAGG 600
CACGTACTTC ACATAATCTG GTTCTCCCGC ATTTGCATTA TGCCTCAGTG GGAAGCAGTG 660
TTGTGGCCTG AAATTATCCC CACTGGTTAA AAGACCGTTC ATGGTTGGTA GTTTTCATTG 720
CAGGCTGCCT GCTGTGGAAG ATCAAAAAGA TGAGGGATAA TGAACGGCAC AGCGTGTTAA 780
CCCTTTCTTT AACTGGGAAC TAAGCCTTTG AGAAAATGAG TGGGCAGGTA GAAGTGAGGG 840
CTCGTTTGCA TTTTGTTTTT GAAATGGGAC ATGTGTTTAG CCACGTCCAC CGGTCTAATG 900
AGAGGTTGAG CCTTCTTGAG CCATATGCAT CTATCAGGAG GACAAACAAG CCAGTAGTTT 960
GTTTGTGGGA CATTTTGTCA GGTAGTGATG AGGTTTGAGG GTTAGAATGC TGGACAGGTA 1020
AAGGTTGCTG GGAGAGGACA CTCATTAGTT TTGATTTCAC CTACAGTTTT AATATGGTTC 1080
ACGCTTTCTA CCTAATGTCA GCCTTTTGTT TCACATAAAT AGTAATAGCA TACCGTGCTT 1140
TGTACTGTTG ATTAGTTTAA TGCAAACAAA CAAACAAAAC AAAAGAATTA AATGATTGTA 1200
AAATAATTAT TATTTGATTT CTGTTTGTCC TTTATTTTTA ATGTATTTAT GAATGTTTAT 1260
ATATGTAGAA AACTGGCCAG ATGACAACTT AACACATTAA TTACATATTA TGTTTTATGA 1320
ATTTATGAAA AAAAATTAGG AACAAAAACT ACTGTGGCAG TGCTGTAATT CAGTCATGAT 1380
ATCAAATTTG TTTACTGATA ATGTTTTGAT ATTTTTCTGG TTGGATCAGT GAAAATTGAG 1440
AACAGGACAA ATTTACCAGG GCTAAATTGA 1470