EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00877 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:25437122-25438398 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NRF1MA0506.1chr1:25437634-25437645GCGCCTGCGCA+6.62
ONECUT2MA0756.1chr1:25437375-25437389TTTATTGATTTTCG-6.15
ONECUT3MA0757.1chr1:25437375-25437389TTTATTGATTTTCG-6.53
Enhancer Sequence
TTAATACAAA ATAAGTCTTT GAATTGTATG TTACTAATTT AATGTTACAT ATCTGCAATT 60
AATCTTATTT ATTTATTTGC ATTTGTTTAT TTCCGTTGTT TATTCTTAAA GCGCGTCTAA 120
ACCTACCTGT ATAGGCGTTC TTCTAAATTT GTTAACCACA TTGGCATTCA CTCCGTTAGA 180
AAGTAAAAAC TGAACATGGG AAATGTTTCC GGTGGCTGCT GCTGTGGTCA GTTCATCCTC 240
GACGTTCATC ATCTTTATTG ATTTTCGAAA TTAATTCGCT TCACAGGTAA AACCAAATGA 300
TGATGATACT GCGAAAACAA TCAGTTCAAC GCTGTAATTT ATTTTTATCG GTCTCCATGA 360
ATAACATGTT CCAATATAAT GCGTAAATAA GCGAAACTGA CTCGTTTATC AAAGTGTTGT 420
GTCTTAAAAT AATTTTTCGT AGCGAGATAT TTGTTCGGAC TTGTCTCTGT CATAAACGTC 480
ACAGCAAAAC CGTGGTGCAG TACTGTCATA CTGCGCCTGC GCACAACAGC TGAGTCAGGA 540
AGACATGAGT TTACGACACA GTAGGAGAGG CTGCAGAGAA ACAGAAATTA GGTTCTGCTA 600
ATGTTTTATG GCTAATGTAA CTGGCATTAG CCTGCTTTTA GATCACAAGA AGTTTTTTTA 660
TTCTTTTTTT CGGGTACATA AGCATATCAC AACGCTAATT ATGCTAACAT AATTGGGTTT 720
TGTGCCATGG AGAAGTTACT CTTCGGGAAT AGGCTAACGT TACCAGGAAA AATCTCTCGT 780
TTTTCAAGAG TAAAGTTATT TTATGGATTT TGATTAAGAC GCGATGTTAG CTAGGCCTGT 840
AGAGATTAAG TTTGACTTGG CTACTTTAAA GTATATTATT TAGCCATTAT GCTGTGTGGG 900
GCGCTTAAGT TAAACTATAT TTTTGATCCA CATAAATTAT AACAAAAAAG CATATACATA 960
CATTCGTGGT AGCCTATATT TATATTTTTT TCATAATGGT TGTTCTGTTT TTGATTGTAG 1020
ATGAACATAA ATCTATTTTC TGCACGATAG AAAGGACGCG AATGGCCATA ATTTTGCCCA 1080
AACATCGTCT GACTTACAGT TTTGTAATGC TATTTCCCCA TCACACGACT GTAGCTAAAC 1140
TATAGCCTGT ATCCAGAAAC AAGGTATTAA ACAATTGTAG CAAATAGTTT TTAATTTTAG 1200
CAGTGAGTTT GTTGCCTCTC TAATACGTTG AAAATAAGTA AAAAGATAAA GGGTCCTGTG 1260
GCTGTGTAGA TCATTT 1276