EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00810 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:23542651-23543810 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:23542848-23542869TGAGAAAAAATGAAAGTTAAA-6.05
PHOX2AMA0713.1chr1:23543760-23543771TAATTGGATTA-6.02
Phox2bMA0681.1chr1:23543760-23543771TAATTGGATTA-6.02
Sox3MA0514.1chr1:23543725-23543735AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:23542748-23542760TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:23542747-23542759TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TGGTTTTCTT TCTCTCTTGA CTGTCTTCTT CTTAGAAACA GCAAGACCAT TAGTAAGGGC 60
TCAGTTTGGC TTTTAACATT TAGCCCCAAC AATGTATTTA AAAAAAAAAC TACTTTGGGA 120
TTGGATGCCA AATAAATGGA TAAGCATGGT ATAAATGTCC AAACATATCA AAAAGGGCTG 180
CAAGGCATTT GAGAATTTGA GAAAAAATGA AAGTTAAAAC TTATGTAAAC CACTAAGCGT 240
TTAAAAAGCT GCGCATGAGG CCCTATATTA TCCAGTTAAG TATTATCTTT AAGAATCAGC 300
ATATGCTGTT AAAGGTTTTT TAAAAAGTCC TCATGTGTAC ACTAAAAGCA CCTCATTGTC 360
TGTCAGCTCG CTACAATGCG TATCATACCA ATAAAGAATT ACGTCATGTG AAAAGCATTA 420
GTGTCCTAAC TATAATCGGC ATACGGTACA TGTGAGCCCT TGGCATGTTC TGGAGATAAA 480
GTTACTCTGG AAAGCGAGTA ACTACAGAAA TGTGGTTTCG AAATGCAGCC TGTATGCCAC 540
CGGGTGGGCT AGACATCAGT TTAAATCTGA TCTAATTTAA TTCCAATCAG CTCTGTAGTC 600
ACGGGGCATT GAAAAAAAAA AACTCACTAT GTATATAATA TACAGTGCAG GCTTCATAAC 660
ATGACATTGA GCTTTGTATC ACCATGGCAT GTTGGTGATA ACTTAATGCA AATTCGAGAT 720
GCATACAGTT CAGTATATAA AAAGTATTAA AAAAATATTA AAATATTACA TCAAATGATT 780
GCATCTGGGT AGAAAAAATA TATAAATACA TTACAACTAT TTTTAAGGTA TTCAAATTTG 840
CACTGTATCT ATGAAAAATC CTAAAGCTGA GAGTAAAATA TAAGAATTCC TCAGTCTAGT 900
GAAGAATCAT GTAGCATCAG ACTGATGATC CAGCAATCAG ACTGCAAGCT CAGCAATAGA 960
CCAAAACAGA GCTTAAAACA CTGATCTTAG ATCAGCAGGA AGCAGTCGGC CACAGACTCT 1020
CACAGTAGGG CCAGTAGGGA GCCCTATTTA GATCAATAGA TAGTGAGTAA CCGCAAAACA 1080
AAGGGGAAAT AGGGACCCTG AGAATGCTCT AATTGGATTA GCTAAATGCG ATTCCATTCC 1140
TGCAAAAATC AATGTGGTC 1159