EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00748 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:21026543-21027228 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.62
CDX4MA1473.1chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.32
FOXC2MA0846.1chr1:21026980-21026992TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr1:21026980-21026991TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr1:21026977-21026994GTATTTGTTTACTTTTT-7.95
LMX1BMA0703.2chr1:21027111-21027122TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:21026789-21026803ATGCATTTTTAATG+6.43
POU4F3MA0791.1chr1:21026789-21026805ATGCATTTTTAATGTT+6
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
TGAGTATCAA TATATAAATT TTCTGCCGAG TGCAGTCACT TTAATCTGCA ACCAAGCATT 60
GAAATCAACA AACAGTGTAA ACATTCAAAA CGTAAATTAT TATTGGATAT ATTTTAAATA 120
CAGTGTTTGT TTTTGTCGTA GAAACAGTAT CGTTAAGCAG AAAATATTTA AGGGATTATA 180
TAGGAAACAC CCAATGTACT TCAGTAAATA TTGAGGGTCA GAGACAGACT GTATAAATAT 240
CTTCTGATGC ATTTTTAATG TTTGCTGATG AGGCAATTTC GGATTAGCCT ATATGTAGAT 300
TGTTTCATGG AAGTTTGCGT GTATTGAAGA AAGCATTATT AGTTTTATGG CCCACTTTTC 360
ATCATAATAC CATTCAGAGA CCAAATGAGA TGAATAAAAA AAGAGGCGTT GTTAACCTTG 420
TTGATTTGCT CTGTGTATTT GTTTACTTTT TATTGTTTTA ATTGTCCGCT TTGACTTGTG 480
CGTCTCGGTC AAAAGCGATT ATTTCCGCTT CCAGGAGGGC ATCCAAAATT TCCCCTTACC 540
AAAAACTATC CGCGCTTTAA TTACTTTATT AATTAAATTA AAGAGGAGAC TGAAACGCCA 600
CGTTTTGTAA TCCTATCACG TAAAGGAGGC ATGGGTGGAG CAATGGTGGT AACCGAAAAA 660
TGGAAACCTC TTTAAACAAT TGTTT 685