EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00719 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:20144334-20145263 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr1:20145152-20145167TGCCCTTTGACCCCA-6.87
Nr2f6MA0677.1chr1:20145152-20145166TGCCCTTTGACCCC-6.46
POU4F1MA0790.1chr1:20144989-20145003ATACATATTTAATG+6.13
POU4F2MA0683.1chr1:20144989-20145005ATACATATTTAATGAG+7.3
POU4F3MA0791.1chr1:20144989-20145005ATACATATTTAATGAG+6.7
RXRBMA0855.1chr1:20145152-20145166TGCCCTTTGACCCC-6.8
RXRGMA0856.1chr1:20145152-20145166TGCCCTTTGACCCC-6.46
RxraMA0512.2chr1:20145152-20145166TGCCCTTTGACCCC-6.73
ZNF384MA1125.1chr1:20144802-20144814TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
TAGAAGATTA TCTTGATGTA GGCATTAAGT TACATTTTAA GTTGTCAGAT CTAGCAAGTC 60
AAAAACAAGA TACGTGGTGG CTCGGTGATT AGCACAACAA GAAGGTCCCT GGTTTGAGTT 120
CCAGTTGGGG TAGGAGGCCT TTCTGTGTGG AGTTGGCAAG TTCATCCTGT GTTTACATGG 180
ATTTCCCCCA GGTGCTCTGG TTTCCCCCAC AGTCCAAAGA CGAATTGTAT AGGTGAATTG 240
GATAAATTGG CCATAGTGTG TGTGAATATG GCAGTGTGTG GGGGTTTTCC AGCACTGAAG 300
GTTACATTAG TAAGTGCACT CTCAGTGTTG GGATGTGGCA GGAAGGGTAA AACATGTGCC 360
AGGGGAATAG GCGTTATTTT TGGTATGGCA ACCCCTGATA AAGAAGGCGG AAGACTAAAG 420
TGAGTATTTG CTCTGTCTCA AAAAAAAGTT TATATATATA TATATATATT TTTTTTTTAA 480
GTCATAAAAA TGACAGTGTG AATGCGGAGG TAAAATGTAT AATTTCAATC TGAACAAGGC 540
AAACCAAGAG ATCCAAACTA CAAGTGTGAA AACACCCATT ATGCCATATT TACATGGCCC 600
TCATCCTTTG AGGAAAAGTA AATCCTAATA CATTGTGTGT GACTTGGCTA GCTTCATACA 660
TATTTAATGA GCTGTTGCAG TGTGTGGCCT ACGCTTTGAT GTAATGTTTC ACAAATTAGC 720
AAGTTAAAAG ACTTCAGCAA GAGGAAGACA CAGACTGCTT TAGTGCCAGA GGTGAAGTCT 780
GGTACACACT GTACGTGTAA GTGGGGAGTG AGTGACCATG CCCTTTGACC CCATGTGTGA 840
CCTCAGTTCT GGAGTGGAGT GGAGTCCTTC TGTGAGTAAA CACACATTCG GCCAACGGGA 900
AGAGAGGATT TCCTCTGTTT AAACACTCT 929