EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00710 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:19859714-19860418 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:19859981-19859993GATTGTTTTTTT+6.44
HOXA10MA0899.1chr1:19859796-19859807AGTAATAAAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr1:19859717-19859729TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:19859716-19859728TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TATTTAAAAA AAAAACTTAC TCGTCAGAGG CCTTCATCCT CCACTGAATC AATCCAGTCA 60
ACATGTCCAG TCCTCCTCCA CAAGTAATAA AAAAGTTGAT GCATGGACAA GTTTTGTGTT 120
TGTTCATTAA AGATGATCTC GGGAAGTAAA TTTCTTCAGT TTTGTCTGTC TTCAGTTCAG 180
TTCAGAGGCC TGCTTTTAAT TTTAAACATC CCTTCAGCTC CCCCTGCAGA CTGACTAGCG 240
TTGCTGCTGG TCTAATCGTC TAAAATCGAT TGTTTTTTTC CAGCACATTT CTCCATTTCA 300
CAAACAAAAC ACGCAGAACA GACAGCTAGC ACTCAAAATT ATAGTATACA CAAAACTGTT 360
TGTTTTGGCG TTGACAGCCA CAAACTTTCT GAATAACGTT AGTGGTGGTA CCGACGTCAC 420
CATAATTCCA ATAATTTATT AAAACGAACG TTCGAAGGCT ATTTAAGTCT GGGACTCCAA 480
TAAATAAAAT AGGCATAGAC GTCATAATAG ATAAATTTAT ATTATATTGT CTTTGGGTTG 540
AACACGATAC GGTGGCCGAG AGAGCTCAAG CGTCTTGCAA GTAAAAAACA ACAACATGCA 600
AATAGAAGAA CACTAAAAAA GGAAAACATG ACCATACGCA TTTGCACATA AACAATCTCA 660
CAACTGCATA TACAAAACTG CATTTTTTTT TTTCAATAAA CCCA 704