EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00661 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:18258576-18260486 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:18259730-18259748CCTTCCTGCCCTCCGACC-6.08
FOXC2MA0846.1chr1:18259435-18259447ATTGTTTACATT-6.32
HOXA13MA0650.2chr1:18259152-18259163GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr1:18259152-18259163GTTTTATTGGT-6.32
NEUROD2MA0668.1chr1:18258902-18258912GCCATATGGT+6.02
RREB1MA0073.1chr1:18260389-18260409TGTTGGTTGTTGGGTTAGGG-6.09
ZNF384MA1125.1chr1:18258780-18258792TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258781-18258793TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258782-18258794TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258783-18258795TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258784-18258796TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258785-18258797TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18258786-18258798TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
AGTGTGGATC ATGAGTTTAG TCACGCATGT GTTTATTATG AAACCAACTT CTGCTTTAAA 60
ACAAAAACAG TCAGCACAGG AGCGTGCTAT CTCAAAAATA AGCGAATTTT ACATAGTTTT 120
TCTCTAGATG ACATGTATAA TCTATTTATA AATAATATTG TTTTGTTTGC GTCTAAACAT 180
TGCGAACATC CACACTAAAT ATTCTTTTTT TTTTTTTTTT TTGCTATCAT ACCATGAATA 240
TTTTCTCAAA TTATCATTAA ACGTGGAGCT AACAGATTAC TAGATAAATA AAGGACTTAA 300
TCGGTTGCCA TCAGCCTTAA TCGGTTGCCA TATGGTTGAC CGGAATCGGG CCAGTGCTTT 360
ACAGCCGCAT CACAACCGCA TGTGCGCGAG CGAGCTGCGG GCCGCACTCG GCCCGGATAA 420
CACTCGCCGA TGCCGAGTCG GAGCCGGAGG CGCCGGAGGG CAGCCGAGCT CGGGCCGATT 480
ACTGCCTGCT ATCTGGGTTG CTTGAGAGCC TGTGTGCTGA TTTTAGTCTC ATTTCCCGTT 540
TTCCAATTTT GTAAAGCAAA TGGCAAATAA CGTGAAGTTT TATTGGTTAA AAGAGATGTC 600
ATGTAACATT ACTAAGATTT TACTTTATTG GTTAAATATT ATTAATTTTT TTCTTTCTGA 660
CGTGGAAACG TGTGACGATG TTCAAGTTCA AAAGTAAAAC TATCCTAATA AGGAAAAACG 720
GGGATAATAT TTATTTATTC AGGTATATGG GCCCTCTTTT TCTTACTACT TATTGAAATA 780
TTTTCTGTAT TTAACAACAA AGACTAGGTA GAAACATACA GCTTCTGCTG CTCTAATTGA 840
CTTAATACTG AAATCGATTA TTGTTTACAT TTAAATGACC CTCGTCATTC TGTCACCACG 900
GCAACCTGAG TTGGTTTACA AATCCACACA ACTGTCTATA AAGTCATCAA TCCTGATCAG 960
CGCGCTTCCA AACTCTGAAC TAATCTCCTG TTAGCTGACT TTCATCAGTT CGGGAAGTTG 1020
TTCATGATGA CTCTGCGTCG TTCAAAGAGG ACCAGGACTC TCCCTGGACA ACTCAAGGAC 1080
TTCTTGCTGG AGCGCTCCAA CAGTTGCATG TCAGACACTT CCGTGGAGCA GCGACACCTG 1140
CGGAACGCGG CTGTCCTTCC TGCCCTCCGA CCTGCAGCTT CAGTCTCCTC AGTGGGTAAG 1200
TGTCCACAGG AGGAGCCCCT CTCCATCCAC GGTCGGAGTG TCCAGGAGTA TCAGCACATT 1260
TACCGCAGTG TGGTGGACTC CACCGTGAAG AAGCGCGCAA GACGGTACAC TCCCCAACAA 1320
GGATTGGAGG TAAAGCAGCG TCTGTGGGAG AAGCTGGACC GGCCTGCGCT GCTGGAGACC 1380
GAGCAGGCTG ATGGACGTGT GTTCATCACG GAGATCAGAT CCGGGTCCAG TGTCCCCCCT 1440
CGTATCGTGG TGGACATCAG CAAGGAGCCG CTGCCCAAGG AGCCCCGGAG GAAGAAGCCC 1500
AGGCACTAAA CCATCCTAGT GCCAGATGGA GGATCATGGG CACGTATGTA CATACTGTAT 1560
ATATTGTATA TAGTTATAGA ATAAGTTTGC AATACATCAA AATTTCACTT TTAATTCAAG 1620
TTTTCATCAC ATTGCTGGAT GTTTTGGTGA TTGTCTGTGT TGCTGGTATT CGTCTCTTGG 1680
GTTGTTGGGT TCTTTGGATG GTTCGCTGTA GGTTAATATG CGTTTAGCAA GGTTTTCTAG 1740
GCGGATTATT GCGTATTGCT GGTCTCCTCT GAGTGGTTTT TGGCACATTA GTGGTTGTTG 1800
TTAGGGTTGT TAGTGTTGGT TGTTGGGTTA GGGTAGGTTA GGGTCCCTCA CACGGTTTGC 1860
AGCTTGACGT GCTGTGAGGG CTTGTGTGCA TCAGTGATGC TGAGAGCTAT 1910