EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-00143 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:4552472-4553914 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:4552506-4552524GGAAAGAAGAAAGGAAAG+7.24
NFYAMA0060.3chr1:4553665-4553676TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr1:4553666-4553681CTGATTGGCTAATTG-6.64
RARAMA0729.1chr1:4552808-4552826CAGTTACCTTTTCACCTT-6.12
RarbMA0857.1chr1:4552811-4552827TTACCTTTTCACCTTT-6.39
Enhancer Sequence
ACGATCGATC AAACAAACTA ACCAACGAAT GAATGGAAAG AAGAAAGGAA AGAAAAAAAT 60
CATATTTTTC CCGCTTTTGC TAAATCAAAT AATTAATAAA GAGAGGTGTG AATATTCTGT 120
ATGCAACATG TGATTTCTCA TATACAGCCC AGTCAGCCTT CACAAGACTC ACCCAAGTAT 180
TCGTTACGTG TCTCACTCTA AAAGCCTTTC CCCCTGAATC CCCATCCAAC CCCCTTCTCC 240
CACTTCCTCA CGGAGCCCAT TGACAATGTG TGACCAAGGG AATCTGGGCG TTCTTGGGCA 300
ATGGGAGTCC CCATGACCAG GCACAAAGCC CCCTGTCAGT TACCTTTTCA CCTTTGGCTG 360
GTGAAAAGGA GGCCCCGAAC AATAGGGCCC GCTCAGCTGG AGATGGTGGA GTCTCATGGG 420
TTTGGGAACT CGCTCACTCT CCGCTCATTT CCTCTTTGAC TCTCCGTGTT CATTCGAGGC 480
CACCTAAAGG TGCATTTGTT CACCCCCTCC TCCTGATAAC ACAGAAGCAG CCTTGCCTGT 540
TATTGCCTTT TAAAAGAAAA GTTGCTAGAG AGACAGACAG ACAATGTGTC AAGGGGGAAC 600
CAGAAGAAGC CTGCATTCTC CTGGGGGAGC ACTTCCTATT AGCCCACAAT GGTCCATGCA 660
TTAGAAAGTG GCTTTTGTGT GGAGGCTATT TCCATGCTAA GTAAACTTGT TGCTTTGGTG 720
TCTTTCATCC ATCATCGCTG CAAGATCGGA TTTAACCACA GATCAGAGCT TGTTGGCTTT 780
TGTAGATTCA CTTTGACATG CTTTTCATTA TATTTAACAA TTAAATTATA TTTAGTTCTG 840
TTTTTAAGAT TGGCGTCAAT GCGAAATGGG TTTGCTTGAT TTTATTTATG TTGAACTGTT 900
GTTTTTACGC ATTTTAATAT GTAATTCTGG TGATAATTCA TAGTATACAG TTGAAACCAG 960
ACGTTTACAG ACTGAATAAA AAGGCATATA ACCATTTAAA AAGGGTCAGA TGTTAATGTG 1020
ACTAAACTTT TTCTCTTTTA GCTAAGTTAG GATTATCAAA TTTGCTTAAT AGCAGAATAA 1080
TGAGATATTT TTTGAGAAAC TGTTATAACT TTTCTTGAAA GTCAAGTTTA CATACAATAA 1140
GATTATTCTG CCTCTGAAAA AGCTCAGATG ATGGTGTCAA GGTTTTGGAA GTTTCTGATT 1200
GGCTAATTGA CAACATTTGA GTTAATTGGA GGCACAACTA AAGAATAGTA TTTAAGGAAA 1260
ACCTCAAACA CACTGCTTCC CTGTGTGACA ACATGGGAAA ACCGACAAGC CAGAATCAAC 1320
AAAACAGCCA GATTACAATT TGCTAAATAA TACTGGGAAA AAAGACTAAT TTTTGGAGAC 1380
ATGTCCTCGG GTCGGATGGA ACTAAGATTG AACTGTTTGG CCATATTGAT TAATGTTACA 1440
TT 1442