EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR010-00124 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_dome 
Coordinate
chr5:2304517-2304909 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr5:2304607-2304618ATATTAATTAA+6.62
LMX1BMA0703.2chr5:2304706-2304717AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr5:2304610-2304621TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:2304611-2304622TAATTAAATTA-6.62
POU4F2MA0683.1chr5:2304709-2304725TTAATTAAATATGAAT-6.16
PROP1MA0715.1chr5:2304611-2304622TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:2304611-2304622TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:2304611-2304622TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
GGTTCTGTTC ACTGAAGCAG AAGCGCGCGT ATGGCAAGCC GCTTTAGCAT TTAAACCTTT 60
GTTCTGACTA TCCATAAATA TATTTAACTC ATATTAATTA AATTAATTTA GAGATATCTC 120
TAATTATATT TTGACTAGTC GAATTATAAT TATGACTAGT CAAAATATAA TTAGAGATAT 180
CTCTAAATGA ATTTAATTAA ATATGAATTA CATATATTTA TGGATAGTCA GATCAAAGGT 240
TTAAATGCTA AAACGGCTTG CCATACGCGC GCGTCTATCA TAGTCCGCCC TCTGTAGCAA 300
CAGCTCACGG TCAGCTCACG TCATGTGTGA TTTTGCGGCC GCCAATACAT CATTATATGA 360
AGACAGAATG ATATTTTAGG GTGAATTGTG CC 392