EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-21058 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr9:35003441-35004193 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr9:35003725-35003736TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr9:35003724-35003737GTGATTAAATTAA-6.28
Lhx3MA0135.1chr9:35003877-35003890TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr9:35003873-35003886TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003874-35003887AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003870-35003883GAATAATTAATTA-7.12
POU4F2MA0683.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.56
POU4F3MA0791.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.15
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT-6.02
USF1MA0093.2chr9:35003696-35003707GGTCACGTGGC-6.62
USF2MA0526.2chr9:35003693-35003709CGAGGTCACGTGGCAT+6.44
Enhancer Sequence
TGTTTTATTC AACTTATCTC TATACATGGG AGGACAAATT GGATTGACAG GCGGCATAAT 60
GGCATGTCCC TGCCCTATTC ACTCTTACCG CGCGTGGACA AAACGTCTGG GCTGATGAGT 120
TCTTGATAGC ATTTGGTGGC TCCTTTGTGT ACTCCAGCTC ATCTCCAAAA GTCAATTAAA 180
ATCCTGTGAT GTTGACACCG CCAGCACGCG CCCCTATCAA ATACAAGTGC GACTCGCGTG 240
AACCCGCGCT CTCGAGGTCA CGTGGCATTA CGCAACAGGT CGGGTGATTA AATTAAATGA 300
TGTGCGCGAG CTTCTGAATC GTTTACGCAA ATCGGCTCGT TTCAGCAATT GTTATGTCAC 360
AAATGCATGT CAAAATACAG TCAGTGTAAC AATTATTTAT GCTCGAAAAG CACATTTACT 420
CTATTTCACG AATAATTAAT TAATTATTAT AATCACAATT ACGGGTAGCA CGATCGCCTC 480
ACAGCAAGGT CACTGGTTCG AGGCTCGGTA GGGTCAGTTG GCGTTTCTGT GTGAAGTTTG 540
CATGTTCTCC CCATGTTTGC GCGGGTTTCA TCCGGGTGCT CCGGTTTCCC TCAACAAGTC 600
CAAAAACATG CTTTAGGTGA ATTGGGTAGG CTAAATTGTC TGTACTGTAT GTGTGTGAAT 660
GAGTGTGTAT GAATGTTTCC CAGTGATGAG TTGCAGTTGG AAGGGCATGC TGCGTAAAAC 720
ATATTTTGAA TAAGTTGGTG GTTCATTCCG CT 752