EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-20973 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr9:31346830-31349505 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr9:31347321-31347337ATTTGTTTACTTATGG-6.64
FOXC2MA0846.1chr9:31347322-31347334TTTGTTTACTTA-7.22
FOXE1MA1487.1chr9:31347539-31347554CTTGTTTGTTTAATT-6.06
FOXP2MA0593.1chr9:31347322-31347333TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr9:31347319-31347336TTATTTGTTTACTTATG-6.19
IRF1MA0050.2chr9:31347244-31347265AATTTCTTTCAGTTTCGGTAC+6.31
IRF4MA1419.1chr9:31347247-31347262TTCTTTCAGTTTCGG-6.05
IRF8MA0652.1chr9:31347248-31347262TCTTTCAGTTTCGG-6.07
IRF9MA0653.1chr9:31347248-31347263TCTTTCAGTTTCGGT-6.08
PAX5MA0014.3chr9:31348843-31348855GAGCGTGACCCC+7.22
PRDM1MA0508.2chr9:31349200-31349210GTGAAAGTGA-6.02
YY1MA0095.2chr9:31348615-31348627GCTGCCATCTTG-6.32
Enhancer Sequence
TTGTGATTTG CATTTGGGTT TATAAAAGAT ACACTTGAAA ACAATTTGTA TTCATTTTAT 60
GTAATTGTGA TGACCTGTCA TATGGCCACA CAAGACTGAG GGTAACAAAC ACACGCACAT 120
TCGCTCAGAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACAAACACAC ACACACGCAT 180
TCACTTAGAC ACACGCGCTT ACACATACAC GCACATTCGC TGAAACGCGC ACATTCGCTG 240
AGACCCAAAC AATACCCTCC TGCTCCTTCA CTAGCTGACA AACGCGCACC TTGCTCAACT 300
ACACGCATAC AAACAGGCAT AACATCCATA AGAACTTTAG GTAATTAGAG ACTGACAACT 360
TCTCTTTATT TCATATCTTT ATTTATAAAA TAAGTTCCAA ATATTACATG TCACAATTTC 420
TTTCAGTTTC GGTACATTGT TTACTGGTTT GGAGTGCACA CATTCTAGTT TACATTAGTA 480
CGGTTTCTGT TATTTGTTTA CTTATGGTTA TTTCTGTTGA GTTAAAGTTA CCGGAGGGTG 540
CAGTGGAGGA TGATGCTGTG GTCCGCTGGA TCGGCCGTCA TGTTTACTGG CAAAGGGCTG 600
GTTCCTGTGT GTGCGTCAAA GATTTATGTC CGGGTGATCC CGCGTGGCGG AACCAATGTG 660
CCGAAATGAT AAGGGGGGGA AAGTTTACTT TGAATGTTTT TCTATATTAC TTGTTTGTTT 720
AATTTAAATA ATTTGTTTAT TTTGAGTAAT TATGTCTTGT ATTTTGTAAA TGTCTTTTTA 780
TTTAGAATTA GTTTGATTAG TAAATATTAT ATTTATAATT GTTATGTTTT ATTGTTTCAC 840
CTATGTTGTT TAAGTGGATC CACCGTTTGT GTATAAATAC TCTGTAGTTG TTTCATTTGG 900
TAGGTCAGTT TGGTTGTGTT CAGACTTCCT GAATTTCTGT TATATTTTTG TTGACCTCAA 960
TTTGTTTTCC AACTAGTTTT TATGTTGGAT TATTGGTTTG TTTAAGTTAA ATAAATATTT 1020
TTTGGCCTTA ATTTTCCTGT GTCCTCGTGC CTTACCGCTG GGCTATCTCA CATATGGTGT 1080
CAGAAGGTGG ATTTTAATAG AGGACACAGG TTTTTTTTTG TTTCCCTCTC CATAGCCTCA 1140
GTACATTGAG TTGCCATGAG CCGTCAGCAA AAGAAGGGGC CCATGAAGCC AGTTTCTGTG 1200
GAGCAAGAGG AGGAGCAAGG AAGGCCTGCA GAGGAGGAAA TGGAGCACAA GGATAAAGAT 1260
GAGATGGCAA GTAGAGAGCC AACTTTGGCT GATTTAACAA GTTTGTTTAG TGCGCATATG 1320
GCAAAAATGG ATTCCAGGGA GGCGGTCAGA AAGCAGGAGC ACATAGATCA AGAACGACGG 1380
TTTAAAGCAT TACAACATCA GTTCAGTTTA TTACAAATGG AAGTTCAGGC CCGCACCTCA 1440
CCTACATCTG ATGCCTGCCA CATTGATACA CATTCTCTAG ATGTGCATGG TGCTCAAGCA 1500
GATACTGATA ATCAGCAGTT TACCTCCCCA AATGTCTTCC ACTCAAATGC TGACCTTAAT 1560
GATGATCGCT TCCCACCACC AAGATTTCGG GAACCTCGAT TAGAGAAGTT GGCTGATTCT 1620
GATGATATCG AGCACTTCTT AATAACTTTT GAACGAATCG CTACAGCCTG TCGCTGGCCT 1680
AAAGCTGACT GGGCATTTCA TTTGATCCCT CTATTAACTG GCAGGGCAAG AGCTGCATAT 1740
GTCCAAATGG ACCTGGATGA CTCTACCGAG TATGATAAGG TTAAAGCTGC CATCTTGGTG 1800
AAGTATGACA TAAATGCTGA AACTTATAGG CTGAGATTTC GTTCCCTCAC TGTTCTCCCT 1860
TCTGAGGCTC CCAAGGAGTT GTATACCAGA CTTAAAGACC TGTATGGAAA GTGGATTAAG 1920
CCCAAAGGAA AAACTACTGA AGAGGTAGGA GAAATAATTA TTTTAGAACA ATATCTGCGA 1980
ATGCTTTCTC CTGAACTTCA GGTCTGGATA AGGGAGCGTG ACCCCACGAC AGCAGCAGAG 2040
GCTGCTGCCT TAGCGGATGT CTTTGTGGCA GCAAGGGGGA AGAATCAGTC CTGGGGTAGG 2100
AAAACAAGCA GTGAGGCACG AAGACCACCC TTTCCTCAAT TTCAACCAAA ATCCATGGCT 2160
GGATTGGGTA AGACTCCTAA GGGAGGTTCC CCAGAAATGA AACCTGCTAT GACTCTGAGA 2220
AGACCAGTGG TCTGCTATCT CTGTGGACAA GAGGGGCACA CAAAACCTGT TTGTCCAAGG 2280
AATGTAGTTA AACCGACTAA TCTGTGTTAT GTTCCTAGAG GTGGGGAGGA TAAAGCCCAG 2340
AAGCTGAATT CCTTGCTGCA TGCCATCACT GTGAAAGTGA ATGGTAAAGA GTTTCCTGCC 2400
CTGATTGATA CTGGGAGTGA CCAGACACTG GTGAGTCGGA AGGTTGTGGC TCCATCTTCA 2460
GTTAATGCAA GTAATAAGCT TTCCATTTGC TGTGTTCACG GTGATGAGAG ATTGGTGCCT 2520
ACTGCAGATC TATATCTGGC TGTTAACAAC CAACCCTACT TGCTAGAGGT GGGGGTAGTG 2580
GATAATCTTC CCTATCCTGT AGTGTTAGGA CGAGATTTGC CAGTGCTTTT GGATCTTATC 2640
CAGCCCATGT CACAGTGCAA TATGGTACTT ACTAG 2675