EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-20746 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr9:16946695-16950175 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr9:16949860-16949872CTAATGATTTTT-6.04
BHLHE40MA0464.2chr9:16947332-16947342ATCACGTGAC+6.02
FOXB1MA0845.1chr9:16947880-16947891ATATTTACATT-6.32
FOXB1MA0845.1chr9:16948035-16948046TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr9:16948035-16948046TATGTAAATAT+6.62
Foxj3MA0851.1chr9:16948513-16948530TTAAAATAAACAAAACA+6.15
HOXC12MA0906.1chr9:16947066-16947077AGTCGTAAAAA+6.02
HOXD11MA0908.1chr9:16947067-16947077GTCGTAAAAA+6.02
HOXD12MA0873.1chr9:16947066-16947077AGTCGTAAAAA+6.62
IRF1MA0050.2chr9:16947520-16947541TAAATGAAACCGAAAGCGAGC-6.65
IRF3MA1418.1chr9:16947517-16947538GTGTAAATGAAACCGAAAGCG+6.93
IRF4MA1419.1chr9:16947523-16947538ATGAAACCGAAAGCG+6.29
IRF8MA0652.1chr9:16947523-16947537ATGAAACCGAAAGC+6.37
IRF9MA0653.1chr9:16947522-16947537AATGAAACCGAAAGC+6.63
PBX2MA1113.1chr9:16947131-16947143TCTGTCAATCAT-6.22
POU4F1MA0790.1chr9:16948783-16948797ATTCATAATTAATA+6.14
POU4F3MA0791.1chr9:16948783-16948799ATTCATAATTAATAAT+6.25
SIX1MA1118.1chr9:16946923-16946934GTAACCTGATA+6.62
SREBF2(var.2)MA0828.1chr9:16947332-16947342ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr9:16947332-16947342ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr9:16947332-16947342ATCACGTGAC+6.02
ZNF263MA0528.1chr9:16949792-16949813TTCTCTTTTTACTCCTGCTTC-6.02
ZSCAN4MA1155.1chr9:16946907-16946922GTTGCAGTGTGTGCA-6.88
Enhancer Sequence
TTGTGATCTG GTGCTATGTA TAAATACAAT TAACTTGACT TCAAGGGGGC GGGGAGCCCC 60
CCTAATATAA CGGTGGGGGA AACACTGTGG GCCTAGAGTG GCACCGGAAT CTTCAGGCGA 120
AACCCAATTC TGAATCGTGC CAGGTGGTCG GTGATCTCAC TGCGTGTTAC GTATTGTGCG 180
TGAGGCCCAT ACTGTTTGAG AGTTTGCATC TGGTTGCAGT GTGTGCAAGT AACCTGATAG 240
TAACTGCAGT AGGCGTTGGG GAAAGTCTAG CCAGATAGCT CATCATTGTG ATTTTCATCT 300
GGATGCCTTT TAACTCACCA TCAAATCTCA AGAAGCATGT AAAGCCAAGT CTGAACTAGA 360
GCTGCACAAT TAGTCGTAAA AAGATCGCGA TCTCGATTCG ACCCCCTAGA CGATCTTAAT 420
CCAGCATTTC TACGATTCTG TCAATCATGT TTTCGAGTTC AGGAGAGAAG CAATGGTGGC 480
CGCACAAGTC TTCACATTGT TTTACGTACG TTGTTCAGCA ACGTGGACAC CGTTAAATGG 540
TGCTGAAAGA GTCACATGCT GTATTTTTAA GATATAACTC AATTCACCCC CTAAAAATGA 600
CATTTCTGTC TTCATGTAAT GTATTTGCGA CCGCAAAATC ACGTGACGTG AGCTGACCGT 660
CAGCTGTTAC CACGCGTGCC TCTGAATGAA GTCTACTTTG GTGAACAGAA CCTGCATAGA 720
CTGGGATTCG TTAATAACAG GTAGTAATGT TGTAAATAAC ATTCAGTTTG TGGCACAGAG 780
TGATCGTTTG GGAGCCGCGC GGGAAGTGAA CCGCTCTTGG CAGTGTAAAT GAAACCGAAA 840
GCGAGCGCAC GGTGTTGTCA GATGTTGCGG ACTGATTCCA GCCCTAAAAG TATCCAAAAC 900
CCGCCGAAAT GCAAAAATAC CCACGCAGTC GTCTGTGTTC AAGAAAACCC TGTCAGGGAC 960
AGATTTAAAG CAAAAAATTA CAGATTGTAA GCATATGTCT CAATCACAGT AATGCAACAT 1020
CAGAGCTCAG CATTAATGAC CAGGACAAGT CTAAAGTGTG TTCAAGTCCA CAGCGCTTTC 1080
ATTTCTAAAG CCGATCGCAG CCCTTTCTGT TGAGCAGGTG AAGACAATAA CCAATCATAG 1140
GGGTGTAAGA CCTCGCCTGT CAGCGCTCGA AAAGCAAGCG GGATGATATT TACATTAGTT 1200
TATTAGCTAT AAAGGCTTGA TACTTTCAGA AAGAGTGTTT TCTTTGAGCA GGTCAAATTA 1260
AGGGTACAGT AGAGTAGGGT AGAGTACAGT TAAGGGTACG TATACTGCTG TATTAAAGAA 1320
CAAAATTGTA TTACAAATAA TATGTAAATA TTTTTATAGA TTTTAATAAA AAAATTCTTG 1380
TGTTGTGATC AAAAAATCAA ATTACGTATG GAAAGCATCG TCATTGCAGC GAGATTTCGA 1440
ATTGAACGGA ATCGATGGCA TGATAATCGT AATCGAACCA AACCGTGAGA CCAGTGTAGA 1500
TTCACACCCC TACTCGTTAC AATTATAGAC CTTTTTCTTG GCTGCTGCAT GGAGGGCGCC 1560
CTTAACGACC AGCGTCTTCC GGTAGAATGT TTAGAACTTC CGCTTACAGC GTTTACAACC 1620
AGTAATTTGC GATCCGAAAA TGGGCTTCAA TAGCGTTTCG AGTGGATTAC AGAGTGTTTT 1680
TGTGACACAC AACTTTGAAA GGTGTGTGTT AAAGCTGTTA TAATCGGTCA GATCTGTGAT 1740
TCAAGCGCGA GTGAAAAACA GCATCGTAAG CCATGTTTCT TTTTGTTCTG CTTAACCACG 1800
TGTCTCCAAA AAAGATATTT AAAATAAACA AAACAACATG ATGTCTTTTG ACTGCTTTCT 1860
GTTATAACTA CATTACACAA TACTTGTACT TTTACTTTGA GTACTTGAGT AGTAAACTTT 1920
GAAATAAACT ACTTGCAATA CTTAAGGACA AAAAGTGTTG ATACTTCCAC TTAAGTATGG 1980
TGCTTAAAGA GCACTTCAGC TTCTACTCAA GTCACTTTTT GTGATAGAGC ACTTGTACTT 2040
TTACTTAAGT CTGCGTCTCT GGTACTCTAT ACATCTCTGA ATCTGAGTAT TCATAATTAA 2100
TAATGGCGGA GATGATAATA TGGTGGAGAA TGCGGGCGCG CAAATTTTTC CATTCCGTTG 2160
TGATTGTATT GCGCGCACCA AAGTGACCAA AAGTGTGAGC AGCTGGCTCT CTGTCTCTCC 2220
ACAGCTGGAA GGGCGCACGT CTTTCAGCCA TTCACTAGCA CACAGATGAC TACTGTAAGT 2280
GTAACTATTA AACTGCAGTT CACAATAATT AAAAATCGAT TTTGCAAAGA CGCACGTCAT 2340
GGAAATGATT TAAATACTAT TGCGCCTGTC TTCTGAGATA GTTGAAATCT ATCCGTTAAA 2400
GGGCTTACTA TTGTAACTAG AGTGAGGCTA GGCGCTGCCT GTTTCTCCTA TTTCTAGACT 2460
ATATTCTCAC GTTGTTTGAA ACTGTTAGAT TAGCTACCTA ACGTTTGAAC CTTTTTGTTT 2520
GCCGCCGAGC GAAATTAGTT CAGAACTGCT GGCTGGCTTC TAAATGAATG TATTTGGGAG 2580
TTGCAAGCTT GCCTATTAAC GGCTTTCAGA TGAAAGGAAT TGTCAGAATC ATAAGCGCGT 2640
TTCCTAAAGG GTACCTGTAT CTGATATGGA TGTAAAATCC CTTATTTTCA GCTTTAAATA 2700
GCGAAAGCCT ATTCTCTTAG AACAGCCGCT GTGAGTCAAG ACAAATCTGT GTGTGTAAAC 2760
TTTCACCGCA GTCTCGAGAG ACGTCTCGTA TTTTATTGTT GTTTATCTAG GTTATCTGAA 2820
TGTAATGGTC AGATATCATA ATGTAATAGT ATGTGTTACA TAATAGTGTT ACTGCGACAT 2880
GATATGAGAA GTGACCGTTT TAGCCAATCT TAGTGATTGG TATTTTACCG TCCGTGAAGT 2940
GAGCCGTGTT CAGTTCATGA ATGACAGTCT TTTTTTGTAA ATTAAACCGC TCCCCGAACG 3000
CTCATTGGCT CATCACACAC GTGTCTCGTG CGCTGTTCAT CCTGTAATGT TTTCTACTCA 3060
TATAGAATTT TTAAATTCTT TATACCACTT TCCAATTTTC TCTTTTTACT CCTGCTTCCA 3120
TCATAGGATG ATAGAAGCTT TATGAGCCAT CAGATACTAA GCATACTAAT GATTTTTACT 3180
TAGATTGGTT GGCCCAAAAT AGTAGATTTT ACTAGTACTG CCTTTATCTT AGACTGGTGT 3240
TTGTGTGGTT ACGGTACAGG TTGTCCATTT TGCAAATCAA AAGATTGGGT TCGTCTGTCT 3300
GACATAACTG ACCCCTGCTG AAGGACACGT CAGATACCTT GGCCTTGTAA CTCGGGTTGC 3360
AAACCGCAGT GAGGCATCAG CAACATCGTA CTCCAAGTAG CATCTACCGT GTCAACTGGC 3420
ATTCGGTCAA TCTTGGTTAA TTACCCTGTC ATGATTCCAC AAGTGTGCCT GCCTGCGTGA 3480