EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-20729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr9:15969460-15970521 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr9:15970305-15970322AGGTAACATAAGGGTCA+6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr9:15970305-15970322AGGTAACATAAGGGTCA+6.26
ZIC1MA0696.1chr9:15970366-15970380TACCCCCTGCTGTT+6.24
Enhancer Sequence
GGGTTTGCGT TTCTTCTCAC GGACAATATG TCGGCACTCT GAAAATAGTC AGAGGATGCA 60
GGATTAACTA TATTTGAATA AGCTGGTCGC ATTAACGCTT ACCTAGTCTT AAAAAAACAG 120
ATCATTAGCC AAGCCCATAC AACTTGCTAT TCCCAGTGGT CGAATGATTA AAAGGTCTAC 180
ATGTTATCGG CACGCAATGG CTACGAATAA TCAAATGCGC CAATTAAATC AATTTCGATT 240
ATGCCGTACG ATAAGGGTAA CGAGACTCCA CATAATCTAC TGGATACAAT GAATTCGCAA 300
AACTAATTAA TCAAAACTTA AAATTTTATT TGTCAGGTAA AATTGTATTC TGCCAATTAC 360
ATAATAAATC ATCAGGAAGC CAATTCAGAG GTGAGACTGT AACAATACAA CATCCATTTA 420
TCAAAGATAA ATCAAAGAGT TAAGAGATGC ATACCTGACC ACAGAAATAC ATTGCAGCAT 480
AAGTCTCAGA GATGCTGCAA TGGGGTGTCT TTTTACAAGA TCTCCCCCTG TCCTAAAGCA 540
CATCTTACCT TATATACTCA AGTCAAAACA AACAGCCATA AATTCAAGAC AATAGAAGTG 600
TCACAGAAAC CCTGACCTGG TCAATTTGAG GACTTAACCA TCTCTTAGGA GGGAGAGCAT 660
CTTATCAAGA TCTTATAGAA GTCAAAAACC AAATCAACAT ATACCAGTAA AATATTACTG 720
TAAACTTAAG ACCACTTTAC CAATCACACA GAGACATTTA AAATGATACC AAACATGAAT 780
ATAGTGATGC AAGATACACC ATATTAAAAC CTTGAACATT TTATGTGAAA TGTGCTCTAA 840
TCAGAAGGTA ACATAAGGGT CAAGAAGGGG GGTTTAAGTG GAAGGAGAAG GGGGACTTCT 900
TCGCATTACC CCCTGCTGTT GAGTAGCTCT GTTTCTCCAG CCTGTGATTG CATTGTCAAC 960
AGTGATTTGA ATAGAACAGT GGAACAGTTG GTTTCTTCAT CACTTCTCAG ATTAGAAAAT 1020
CTATTGGAAC ATTGCATCTT GTCTCATGAA ATTCCATAAC A 1061