EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-20726 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr9:15964217-15965527 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr9:15964798-15964815AGGTAACATAAGGGTCA+6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr9:15964798-15964815AGGTAACATAAGGGTCA+6.26
ZIC1MA0696.1chr9:15964859-15964873TACCCCCTGCTGTT+6.24
Enhancer Sequence
CACATAATCT ACTGGATACA ATGAATTCGC AAAACTCCAG AATTAATCAA AACTTAAAAT 60
TTTATTTGTC AGGTAAAATT GTATTCTGCC AATTACATAA TAAATCATCA GGAAGCCAAT 120
TCAGAGATGA GACTGTAACA ATACAACATC CATTTATCAA AGATAAATCA AAGAGTTAAG 180
AGATGCATAC CTGACCACAG AAATACATTG CAGCATAAGT CTCAGAGATG CTGCAATGGG 240
GTGTCTTTTT ACAAGATCTC CCCCTGTCCT AAAGCACATC TTACCTTATA TACTCAAGTC 300
AAAACAAACA GCCATAAATT CAAGACAATA GAAGTGTCAC AGAAACCCTG ACCTGGTCAA 360
TTTGAGGACT TAACCATCTC TTAGGAGGGA GAGCATCTTA TCAAGATCTT ATAGAAGTCA 420
AAAACCAAAT CAACATATAC CAGTAAAATA TTACTGTAAA CTTAAGACCA CTTTACCAAT 480
CACACAGAGA CATTTAAAAT GATACCAAAC ATGAATATAG TGATGCAAGA TACACCATAT 540
TAAAACCTTG AACATTTTAT GTGAAATGTG CTCTAATCAG AAGGTAACAT AAGGGTCAAG 600
AAGGGGGGTT TAAGTGGAAG GAGAAGGGGG ACTTCTTCGC ATTACCCCCT GCTGTTGAGT 660
AGCTCTGTTT CTCCAGCCTG TGATTGCATT GTCAACAGTG ATTTGAATAG AACAGTGGAA 720
CAGTTGGTTT CTTCATCACT TCTCAGATTA GAAAATCTAT TGGAACATTG CATCTTGTCT 780
CATGAAATTC CATAACAGTT CTTATGGTCT GATATTTTGG ATCCTTACAG TCCTCCCCTG 840
GTCCCTTGGA GCAATTCTGA GCAGTCTCTA AGGGAACACA AGATCATTTA GATGGCTTTG 900
GCGAGCGTTG GTAGTTGTAG TATAGCATTG TAGTAGCGAT GTCATCACCT GAAATCACAA 960
CATTAAAAGC AGCTTCAACA TTAAAATGGA GTTATGTTGC TGAACCCCAC AGTCTCTTTA 1020
GTTGTAGACA TACGGTGTTG AGCTTGGGCT CAAGTGACTG CTCAGGCATT TATGCCATCA 1080
GCTTCGTCGC ATTTGTGTCC ATTTAAGGTG GTATTCAGTC CATAGGATGA CAAAGTTCAA 1140
TGTGTGATCA AATATATTGC AAGTCTCATT GCACTTTGAG AACCATTCAT GTGCATTAGA 1200
TCCTCCCCTG GTCATTATCT GTTCCACTGG AAAAACCTTT GTTAGCATCA AACATAAGGT 1260
GAGGTTCACA GGGCAGTTCA TATTTTTCAG GTTAAGGAAC AATATCACTA 1310