EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-20238 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr8:44247059-44247699 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr8:44247092-44247103AAGCCATAAAA+6.62
CTCFMA0139.1chr8:44247583-44247602TCAACACCAGATGGCGCTA+6.54
Lhx3MA0135.1chr8:44247458-44247471AAATAATTAATTC-6.22
Enhancer Sequence
AAATTTGATT CATGACTTAA TTGCTCAACA ACCAAGCCAT AAAACAAACT TAAATTGAAA 60
TTGATGGGAT GATACAGGCT TTTGTCTACC ATCTGTAACA TAAAATACCA ATAACAACTG 120
TTAAATGTTA TCAGATGTCG AGTTATATAT ATTAATTCGA ACAAAATTTG GTGAAAATGA 180
TGACTGACTC CTTACCCTCT CTTCAAGTAA GCGCCAAATG ACGTTCAATT AACTCAGACT 240
AGCCGTTAAC CTGACTTCAT CTGCTGTATC CCTCCGCGCC GTAATAACTC AATAATCGTT 300
ACTTACACCT TTTCAGTATT ATTTCCGAGT TATTCAAGCT TTACTGCCTT TTATAGTTAT 360
AATTGCTAAA TTTCTATCAA AAACCTTGTT GAAAATTAAA AATAATTAAT TCTTAAAATA 420
TACTATTTGA TTCGGAAGAA TACACAATTA CCCGTTACAG GGGGTCACCT GGCCCGGCGG 480
GAGGTGCTTT TAATGATTAC TCATATTAAT ACTATGACAG ATGTTCAACA CCAGATGGCG 540
CTAAAATACA ATAAAAGCCA TTGTTATAGG CGGCGCTGTA AACACAGTTG CTATTTTAAA 600
CAGCTTACCT TACAAGAAGT TTATTAATGT AACGCCTTTT 640