EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-18622 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr7:24185689-24186711 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr7:24186059-24186070ATTGATACATT-6.62
DMRTA2MA1478.1chr7:24186058-24186070AATTGATACATT+6.92
DMRTC2MA1479.1chr7:24186058-24186070AATTGATACATT+7.22
IRF1MA0050.2chr7:24186141-24186162GAAATGAAAGAAAAAGAGAAA-6.31
SP1MA0079.4chr7:24186364-24186379CTGACCCCGCCCCCC+6.2
Enhancer Sequence
TATGATCAGA TGCTTACTTA ACTGCTGGTT TCTCACCGCT GCCAATTTGT TGTTTATTTT 60
GTTATTGAGA CAAAGGAGTG CAGCACATAT TCATATATTT TTATCAACAA ACAAAATTTC 120
TTTTCAAAGA ACGAAAAATA ACTTGGTTGT GATTATTTTG AGTAACGTTC AGTCTCCTAA 180
GTAATGAAGT TAACTTCACG ACCAACGTTC TCTATAAACA TTTCATGTAA TAATGCGCAA 240
TAGTTTTTAA TCAGTGTGTG CTTATTGAAC TAAACACAAA TGACCCGAAT GTGCTTTGTG 300
TGTTCATGCA TAGGTGGCTT TCAAAATTGG CTCAGACACT TTTGTACAAG CTTTATGCAT 360
CGTTCCTTTA ATTGATACAT TATGTACATC CCTTTCTTTC ATAAATCAGG AAAACTTTTC 420
TTTACATCTT TACAAAGTTC CTGTGTATTG AGGAAATGAA AGAAAAAGAG AAAAGGGGGA 480
ACATAAAAAA AAACGGTTTT AAACAGCTTA AGAAAACCAA GTACAACGAT TTCAGACTCA 540
AAGAACCAGG AGATCACTGC AACCAAACAG GTAAAGCAAG GTCAGATTTG CCATGCTCAA 600
AACCTCTTTT ACATACTCCT AATCCGTTCT ACCCAGCCCT TATTATCATA CCAAGCTCAG 660
CCCCTTTTAT GGTAACTGAC CCCGCCCCCC ATGTGTGGCT GCACATCATT TCCCTGCTGT 720
GCTTTGTGTG GGCTTGTTTT TACAGTAGCA GGCAGCCAAT GATTGAAATG TGTTCAACAG 780
CCTAAAACAG CCAACTTAAA ACTGATAAAC ATGGGTATAA AGCAAAGAAA GAAAACTATC 840
ACTGCCATCT TTTAAGTGCC ATACATTTCC AAAGTATTTT CAGGGATTTA CCCATAAATT 900
AATGGTAATT TACAATAAAT ACTAAACCCA CCAGCACTTT GCAATGTTTT AAGAGCATCC 960
AATAAGTGCT AAGAGGATGC AGGGACTCTG AAAGTTGCTT TTGCTCTGAC TGGCACAAAT 1020
AG 1022