EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-18165 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr6:57814807-57816737 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr6:57814880-57814891GGCAATAAAAC+6.32
CDX4MA1473.1chr6:57814880-57814891GGCAATAAAAC+6.62
HOXD9MA0913.2chr6:57814881-57814891GCAATAAAAC+6.02
KLF14MA0740.1chr6:57816393-57816407GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr6:57815874-57815885GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57816187-57816198GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57816395-57816406GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr6:57816298-57816308GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr6:57816381-57816394TTTAAGTGGTTTG-6.24
SP1MA0079.4chr6:57815873-57815888TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57816186-57816201TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57816394-57816409GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP1MA0079.4chr6:57816040-57816055TGTGGGCGTGGCTTA-8.07
SP3MA0746.2chr6:57815873-57815886TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57816186-57816199TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57816040-57816053TGTGGGCGTGGCT-6.37
SP3MA0746.2chr6:57816394-57816407GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr6:57816038-57816055TTTGTGGGCGTGGCTTA-7.11
SP4MA0685.1chr6:57815871-57815888TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57816184-57816201TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57816392-57816409TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr6:57815873-57815885TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57816186-57816198TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57816040-57816052TGTGGGCGTGGC-6.22
SP8MA0747.1chr6:57816394-57816406GGGGGGCGTGGC-6.44
Enhancer Sequence
TGTACATTTC CTAAAGGAAA TGTGAATGGG GTTTGCGTGG CAAATCGATG GGGTAGAAAA 60
CGGTAGTAAA CTGGGCAATA AAACAACATG CTAATCGAGT TGCTAACATG ATGCTAACAT 120
GATTAGCATG TAGCTAACAT GATGCTAATC GTGTTAGCAT CATGCTAGCA ATATGCTAAT 180
CGACTTGCTA ACATCATGCT AATATGATTA GCATGTAGCT AGCATGATGC TAATCATGTT 240
AGCATCATGC TAACAACATG CTAATCGAGT TGCTAGCATC ATGCTAACAT AATTAGCATG 300
TAGCTAGCAT GATGCTAATC GTGTTAGCAT CATGCTAGCA ACATGCTAAT CGACTTGCTA 360
GCATCATGCT AACATGATTA GCATGTAGCT AGCATTATGC TAATCGTGTT AGCATGATGC 420
TAGCAACATG CTAATCGAGT TGCTAGCATC ATGCTAGCAA CAGTGCTAGG GTGCCCTGAG 480
TGGTTTCTAG GTGGTTGCTA AGGTGTTGCT AGATGGTTGC TAGGGTATTC TAAGTGGTTG 540
CTAAGACGTT GCTAGGCGGT TGCTAGGGTG TCCTGAGTGG TCGCTAGGCC CTTACTAAGG 600
CATTACTAGG CGGTTGCTAG GTGGTTGATA GGCGGTTGCT AGGGTAATTT GGGTGGTTGC 660
TAGGCAGTTG CTAGGGTACC CTGGATGGTT ACTAGGCAAG CCTCACATAC ATGCCTGATG 720
AAATATTTAT ACTTAGTAAG CATTTCTAGC AAGTTACAGT ACTTGGCTAG TCAATATTAG 780
CATGTAGCTA GTCACTGCTA GCATGTGTAG CATACAGGAA GTTCCGTTTG CTAGCATGAG 840
TGAAACGAGC CAATCCCCAT GTCTCTACGA TGTTCCGATG CTGAGATATA GCTGTTGATG 900
AATGGTTGCT AGGGTACTCT GTTTTGTTGC TATGGGCGAG GTTACAGAGT GAACTTGAAT 960
GTGGTTGGCT GTCTAAGTCA AATTAAGCAA CCCCCATGTC TCTATGACAC TGCTATGTAA 1020
AGATATGCAT GTAGACCAGT TACAATGGCA GTCTATGGGA CCAGTTTGGG GGCGTGGCTT 1080
GTGAGCTTCA TTATCATATT GAGATGCTCA TTGGTTGTCT GAGTCAGATG AGCCAACCCC 1140
TAAGTCTTTA GGACACTGTT ATGCAAAGAT ATGCATGTAG ACCAGTTAAA ATGGCAGTAA 1200
ATGGAACAGC TATTAAGGGT ATTTAAATGG ATTTGTGGGC GTGGCTTAAG AGCTTCATTA 1260
TCATATTGAA AAGCTGATTG GTTGTCTGAG TCAGATGAGC CTTCCCCCAA GTCTGTATGA 1320
CACTGTAATG CAAAGATATG CATCTAGCCT TATTATAATA GAAGTCAATG GGATCAATTT 1380
GGGGGCGTGG CTTGTTAGCT TCATTATCAT ATTGAGATGC TGATTGGTTG TCTGAGTCAG 1440
ATGAGCCCAC CCCCATGTCT CTATGACACT CCTATGTAAT GTTATAGATG TGTGACCTTT 1500
ATAATGGAAG TCAATGGGAT CTGCAATGGG ACATCCCACC CCATGTTAAG TCAATGGGGC 1560
ACTTATTAAG GGTCTTTAAG TGGTTTGGGG GGGCGTGGCT TGTGAGCTTC AAAATCATAA 1620
TGAGATGCTG ATTGGTTGCC TTAGTCAAAT AAGCCAACCC CCAAGTCTGT ATGACAGTGC 1680
TATGTACTTT GATTGACATA TGACATTTAT AATGGGAGTC AATGTAATGA ATGGGAGTCA 1740
ATGGGCAATG TAAAGTCAAT GGGAACCCTT TTGGGACGTC CTAGCACCCC AGGGGTACAA 1800
CCTATACCCC CTTTCAGGGT ATGTTCTCAC TTAGGCTGCA ACCCCCTACA GATGTTGTGA 1860
ATCCCATATT TCTGTGAAAT TCACACTCGG CGCTGTGATT CGTCAAAGTT CGGCTCCATG 1920
TAAAGTCAAT 1930