EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-17880 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr6:41080275-41081929 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX9MA0781.1chr6:41081221-41081238GGACACGCTTCAATGCT+6.14
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:41081155-41081172TTACCTTCCGATGACCT-6.06
Spz1MA0111.1chr6:41081286-41081297GCTGCTACCCT-6.02
ZNF384MA1125.1chr6:41080638-41080650TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
ACCACCTTTC CGCGTTGATC TCATTTTCCT TTTTTGTTCT AACGGCTCAG TGTCTATGAT 60
TAGATCATTG TGACTTGCTG CATGTTGTGC ACATTCAGAT GCAGAGGTTT GTTGATCAGT 120
GGTTGAGCTT GATGGATGAC CAAAATGGGT CGTTTCTGTT GTTGTGTGGA ATTCAGTTTG 180
CCCATGCTGA GACTCTGCAA TCAACCCATC GTCATCATCT TTCTCGATAT TTCTGTTAAG 240
ACCTTTTGGA CCTCGTCTGG ATGAACCAAG TCTCTGGTTC TTCTTGGGTT TTCTGCCTGA 300
CATGGCTACC CATATCATGA GACAAACATT TGGGATGTAA TTTTAAAGCA TGTTTGACAT 360
TGTTTTTTTT TTACAAGAAC ATGATTAAAA AAAGAAACCA GAGAGCATTA TTTATGAACC 420
ACATGTATAT GACTCATACC AAATGTCATG CATGTGCTCT CAAATCAGTC ATTTGCTTGT 480
GGTTTTCCAT AATGAAAACC AGAGCACACT AACAAGATGT TTTATATGCT AACATATTAG 540
ACTGTAATAA GCTTAAGTGT TTTACTGTCA ATCTAAAAAA TGCCACAAAC ATTTCATCAC 600
ATTTGTCGTC GCCATCAACA CTCCAACCAT CATTTTGTTT TTGTCATACA GACTGTTCTG 660
GCATCCACTT ATTACAATAC ATCTTACAAC CTAAATGAGC AATGAAATAC TTTTCTTTAG 720
TCTGTCTTCT ACAGTGAAAC ACTGCTCCAT TACTTGTAAT GTTAATATAA GCAATATAAA 780
GACAAACATA CAAATATTGT ATGTTTTGCA AATCACAGAG TGTAAATGTA AGACATCCCT 840
CTTAAATCTG TTGATGCTAC AAAAGTACCA ATAACTGACA TTACCTTCCG ATGACCTCTC 900
AAGAATCCAT CCAATTTGAC AGTCTCATGG GTTTTAGTAA AGTACGGGAC ACGCTTCAAT 960
GCTTTTGTGT TTCTCTTTTG AAGGAGGCTA AGCTCATGAA GCTTCCTTTA TGCTGCTACC 1020
CTCAACTTCC TGTACTGTTG ACATAAATTG CATTGTAAGG CAAGTGTGAA CTTTTGAGTT 1080
TATATTTTTG ACAAGTTGCT GATCGTTCTT CCTGTGTAAG CGAATGAGAC ATTTGTTGCA 1140
GTGTAATATT TTGACTGCAG TTCAAGTGCT TGTTTTAATC CTCCTTAATA CTTTTAAATC 1200
CTGCTTTAAT TTAAAAACAC ACAACCGTGT TGAAAATGAT TGCACTGCTG GGTTTTCAAT 1260
GCAGATCACA ATCAAAAACT TACAATACAA TTTAATACAA AATATAGATT TTACAATGCC 1320
TTTGCCAGTT AAAGAACACA AGTAAAGATT AGTTTGCCAT TATTAAATCA CTGAAAACAA 1380
TTACTTTGTA TAACTAGCAC TTCTTGTGTG TCTTACCTTT TCTTGCTGAA TGCCTCAACT 1440
GTAAACCACT TAGGACAAAA TCATCTGCTA AACGACTAGC TTAAATAGAA TGTCAATAAT 1500
TTAATTTTTT TAATTCATAT TTGTTACTGA AGTAGAAACT ATAACATGCT GGTAAGAAAG 1560
ACTGAAGGCT ACATGCAGAA ATGACCTGGA TAAACACATG CTGTAAGTCT ATAATAAATA 1620
ATGCAACAAT TATGTTAACC AATTAAACCA GTGG 1654