EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-17292 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr5:71416353-71417018 
TF binding sites/motifs
Number: 57             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr5:71416724-71416739TGCCCTTTGAACTTT-6.05
HNF4GMA0484.1chr5:71416973-71416988TGACCTTTGCTCTCT-6.41
HNF4GMA0484.1chr5:71416579-71416594TGACCTTTGACCTCA-6.55
HNF4GMA0484.1chr5:71416491-71416506TGACCTTTGACCTCT-7.22
HNF4GMA0484.1chr5:71416663-71416678TGACCTTTGACCTCT-7.22
HNF4GMA0484.1chr5:71416696-71416711TGACCTTTGACCTCT-7.22
HNF4GMA0484.1chr5:71416940-71416955TGAACTTTGACCTCT-7.99
Hnf4aMA0114.3chr5:71416938-71416954ACTGAACTTTGACCTC-7.51
NR2C2MA0504.1chr5:71416498-71416513TGACCTCTGACATCT-6.5
NR2C2MA0504.1chr5:71416383-71416398TGACCTCTGCCCTTT-6.73
NR2C2MA0504.1chr5:71416744-71416759TGACCTCTGCCCTTT-6.73
NR2C2MA0504.1chr5:71416376-71416391TAACCTTTGACCTCT-6.83
NR2C2MA0504.1chr5:71416940-71416955TGAACTTTGACCTCT-6.99
NR2C2MA0504.1chr5:71416813-71416828TGACCTCTGACACTT-6
NR2C2MA0504.1chr5:71416579-71416594TGACCTTTGACCTCA-7.73
NR2C2MA0504.1chr5:71416491-71416506TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2C2MA0504.1chr5:71416663-71416678TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2C2MA0504.1chr5:71416696-71416711TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2F1MA0017.2chr5:71416379-71416392CCTTTGACCTCTG-6.74
NR2F1MA0017.2chr5:71416494-71416507CCTTTGACCTCTG-6.74
NR2F1MA0017.2chr5:71416699-71416712CCTTTGACCTCTG-6.74
NR2F2MA1111.1chr5:71416489-71416500TCTGACCTTTG-6.14
NR2F2MA1111.1chr5:71416577-71416588TCTGACCTTTG-6.14
NR2F2MA1111.1chr5:71416661-71416672TCTGACCTTTG-6.14
NR2F2MA1111.1chr5:71416694-71416705TCTGACCTTTG-6.14
Nr2f6MA0677.1chr5:71416357-71416371TGACATTTGACCTC-6.41
Nr2f6MA0677.1chr5:71416940-71416954TGAACTTTGACCTC-6.83
Nr2f6MA0677.1chr5:71416376-71416390TAACCTTTGACCTC-7.31
Nr2f6MA0677.1chr5:71416491-71416505TGACCTTTGACCTC-8.42
Nr2f6MA0677.1chr5:71416579-71416593TGACCTTTGACCTC-8.42
Nr2f6MA0677.1chr5:71416663-71416677TGACCTTTGACCTC-8.42
Nr2f6MA0677.1chr5:71416696-71416710TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr5:71416357-71416371TGACATTTGACCTC-6.35
RXRBMA0855.1chr5:71416376-71416390TAACCTTTGACCTC-6.92
RXRBMA0855.1chr5:71416940-71416954TGAACTTTGACCTC-7.22
RXRBMA0855.1chr5:71416491-71416505TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRBMA0855.1chr5:71416579-71416593TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRBMA0855.1chr5:71416663-71416677TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRBMA0855.1chr5:71416696-71416710TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr5:71416357-71416371TGACATTTGACCTC-6.11
RXRGMA0856.1chr5:71416376-71416390TAACCTTTGACCTC-7.08
RXRGMA0856.1chr5:71416940-71416954TGAACTTTGACCTC-7.42
RXRGMA0856.1chr5:71416491-71416505TGACCTTTGACCTC-8.12
RXRGMA0856.1chr5:71416579-71416593TGACCTTTGACCTC-8.12
RXRGMA0856.1chr5:71416663-71416677TGACCTTTGACCTC-8.12
RXRGMA0856.1chr5:71416696-71416710TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr5:71416357-71416371TGACATTTGACCTC-6.22
RxraMA0512.2chr5:71416376-71416390TAACCTTTGACCTC-7.08
RxraMA0512.2chr5:71416940-71416954TGAACTTTGACCTC-7.38
RxraMA0512.2chr5:71416491-71416505TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr5:71416579-71416593TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr5:71416663-71416677TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr5:71416696-71416710TGACCTTTGACCTC-8.12
TCF7L1MA1421.1chr5:71416727-71416739CCTTTGAACTTT-6.37
TCF7L1MA1421.1chr5:71416603-71416615CCTTTGATCTCT-6.44
TCF7L2MA0523.1chr5:71416601-71416615GTCCTTTGATCTCT-6.37
Tcf7MA0769.1chr5:71416603-71416615CCTTTGATCTCT-6.44
Enhancer Sequence
ACTCTGACAT TTGACCTCTC TTCTAACCTT TGACCTCTGC CCTTTATCTT TTGTTCTCTG 60
ATCTTTGTCC TCATCCCTGT TCTTTGATCT CTGAACTCTC TTTTATACAC TATTCCTTGA 120
CATCTAAACA ATACCATCTG ACCTTTGACC TCTGACATCT GACTTCAATC CTTTGACCTG 180
ACATTAGACC TTTGACATCT GGTCTTTGAA CTTGGTATTT GTTCTCTGAC CTTTGACCTC 240
ATCCCTTGGT CCTTTGATCT CTGAACGCTA TCCTTTATAC TCTATTCTCT GACATCTGAG 300
ATATATCTTC TGACCTTTGA CCTCTACACT CTGCCCTCTT TTCTGACCTT TGACCTCTGA 360
CTTCAATCTT TTGCCCTTTG AACTTTATAT TTGACCTCTG CCCTTTACCT TCTGGTCTTT 420
GAACTTGGTG TTTGTCTTCT GACCTCTATC CTCTGAAATT TGACCTCTGA CACTTCACCT 480
CTATCCTCAG ATTGCTATCT TCTGACCTTT TGTTCTCTAT CCTCTGACCT TTAATCTCTG 540
AACTCTATCC TTTATGCTCT ATTTTCTGAC ATCTGAGCTA TATCTACTGA ACTTTGACCT 600
CTATACCTTG CCCTTTATCC TGACCTTTGC TCTCTGAAAT ATATATTTTG ACATTAGACC 660
TTTGA 665