EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-17000 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr5:52539850-52541239 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr5:52540647-52540660AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr5:52540648-52540661AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr5:52540649-52540659ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52540649-52540659ATTAATTAAT-6.02
ZSCAN4MA1155.1chr5:52541082-52541097ATGTCAGTGTGTGTG-6.13
Enhancer Sequence
TAATGAACCA GATCACTACC GATATTCAGA CAAAATGCAG CAAGTCACCT AGAGAAAACC 60
ACAGGAAGAA TACTACCAGG AGTAGAGCAT GCGACCTGAA GATTAATTTG ACTCAACACG 120
AGAAACCTCA GATGGCCAGG ACTTGGGACA ATGAGCTTGT CCTAAACCCA CGGGCGAGGA 180
CCCATTGGAA AGCAAGCCTG GTGCCCCGCT GTAAGAAGCC ACATGCAGGC AGAACTGCTC 240
TATGCTTTTC TTATATGACT ATATCTTGTT CAGAAATATT AATGTCAAAG ATTAAATTGT 300
CAAAAAAAGA AAGACAGTGC AGCAGTATTG TTGTATGGCT GCAGATGAGC ACAGGCCTCA 360
GTGACACATG ACCTTTATCC AGCAGAGGCC CTTTTGTTCT TTTGTTTAAA GGTGAGAAGA 420
TGCTGGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA CACTGAAACA ACATTTAATG TGATAAATAA 480
ATGCTGTTGT TTAGACAGAG ATCTGCATCT GAAAAAAGCT TAGTCTTTTA AAAGATATCA 540
GAGTGCCTAT CACCATGTGT GTTCATGGAG CTTGTTTCCA GCAGAGCACT GAAGAGGCAC 600
TTATCCTAAA AGGCTGCATA GGTTTAAAAT AATGAAGTGT ATTTTCTTAA TTTAAGGATG 660
GCACATTTTT AAATGACATA AATAGTTTGA ATAATCATTT AATATATCTC AAACACTGAC 720
TCTGTGTTGA ATTATTTGTT TAGTTTAAAT GCCATACATG AATATACTGA AACAGAGCTT 780
GATGACACAG ACTATTTAAA TTAATTAATT TTTTTTAAGA ATATAAAATA ACAGCACAGT 840
GGAGGACTGT TAATTTTGCC TCAGTGTAGC AGATCCCAAT CTGTACATAA CAAACAATCA 900
CACCGGAAAC AGCAGGACAG CTTTGCATCA CCTTTTCTAC TTTCACACAC ACAAAATAGA 960
AACACAAGTG CAGGAGAAAC TTTTGCACGT CCTTCCTCGT CAGCGTCTGA ACTCCGGCTG 1020
AGGCTGACGC AACTCTCCCG TACTCTCCGA GAGCAACGCG TGCAACGCTA ATTGCGGTCC 1080
CACTTAAACA AATGCCGAAA TAAGGTTCCT ACGCCCGGTA GGCATATGAT ACATAAATTA 1140
CTTGTTTTTA GTTTTGGGAA TAATATTCAC GAATATTATT ATAAAAATGA ACATACCTCT 1200
TCCCTACTGG CTACATTAGC ACACTGTTAT AAATGTCAGT GTGTGTGCTT GAATATTAAA 1260
TGTCATGTAA AAAACAACAC CTCAAAGCAA AAATAAATTA TTTTATTAAA GAGAAACACT 1320
TTTTTTTAGG TTTGAGGTGA AATGGGACTA TTGTGTAAAT GTTTTAGAGC TGTAGTTTTC 1380
AGTGTGGTC 1389