EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-16767 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr5:40728047-40729186 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF3MA1418.1chr5:40728225-40728246AGGTTTCTCTTTCCTTCTCCA-6.36
RORBMA1150.1chr5:40728423-40728434GTGACCTAATT-6.62
ZNF282MA1154.1chr5:40728112-40728129TTTTCCCATAACAAGGC+6.16
Enhancer Sequence
TGTTTGATCC CCCTTCTCTT TTCCTCTGCC ATGTTTTGCA AACATAAAAA ACTCACAGAA 60
TGGCTTTTTC CCATAACAAG GCTTTTACAG GGCTATAGAG GGGGCTGGGG AGGGCTGAAC 120
GGGGTGGAGG AAACCCGGTG GTGGTGTTTG GTTTCACCAC ATAAGCTTGT GGAAAAGAAG 180
GTTTCTCTTT CCTTCTCCAG CCCGTTTTAG TAAAATTAGT CTAATGTATT GTTTTTTGAC 240
ACTGAGCGTA TTAACACTGA ACTCTGTTTG TTCTCAGAAG AGGCAGATCA GCACTAAATC 300
CTGCACAATG AACAGCTCCA AACCCTCTTT TACATTTTAA AAAAGGAGTT CAGGGCTGTT 360
TATTCAGCAC CTAATGGTGA CCTAATTTAC TCGAAGTCAC TCACATTTAA GCAAAACATC 420
TCTTGGAGAA AATAGGAAAT GAGGCAATTG TGAAATCACT GAAAGGAAGA CAAAGTTCCC 480
CCCCAGCCAG GAAGGTGAAG CAGTCTTTGT GGTTAAACAA ACGTTGTCAT TGGGAAGGGG 540
TTTAAAGATA TGCACCTCTT TGTTTTGCTG AACACACACA CACACACAAA ACGTGTGGAA 600
GTGAGAGACA GAGAGCCTAC ATGAAATAGC CTCTACAGTT AGTCTGTTGA TATACTTGTA 660
TGTCCTGTCC TGAATTCTTC TCAAGTAACA CACCTCAATT TAAGCCCATT ATTACCATCA 720
TAAAAATGCT CGGAGCCCCT TCTTTGAAAT AGACACGCAT GCGCACACTC TCTCTCACAC 780
ACAGCACACA CAGTAACTCC AGTGTCAACA TAAGACATTC CTTAACTTTA CAGGCCTGCT 840
CCACCCCTAC GGTCTCCCGT TCTGTTTGAT TGCACTGCTT TGCTCATATG TTTTGGGGTC 900
TGGAGAGCCA TTAAGTTCCA CAGCATGCAG TCTCAAGCTA AAACACATGC ATGGAGCCAG 960
TTCTCCATAT GGCACAAAGG TTGTGATTTT TTATTTTTTT TATCCAGCAG CACTGTCATT 1020
AGCCTTGTGC GGTAGAAGCT AAGGCAGGCC TTCTGACAGG TGTGGCGGGT TCATTTTGGA 1080
CGTGTGCTGT CAGTGGAAAT ATTTAATAGA ATTCCAGTCG TCTCAGTTTT AGATCACCT 1139