EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-16212 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr5:1130170-1131353 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr5:1131065-1131076GGCTGTGATTT+6.02
Gfi1bMA0483.1chr5:1131065-1131076GGCTGTGATTT-6.02
NR2C2MA0504.1chr5:1130431-1130446TAACCTTTGACCTCT+6.83
NR2C2MA0504.1chr5:1130431-1130446TAACCTTTGACCTCT-6.83
Nr2f6MA0677.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC+7.31
Nr2f6MA0677.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC-7.31
RXRBMA0855.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC+6.92
RXRBMA0855.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC-6.92
RXRGMA0856.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC+7.08
RXRGMA0856.1chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC-7.08
RxraMA0512.2chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC+7.08
RxraMA0512.2chr5:1130431-1130445TAACCTTTGACCTC-7.08
Enhancer Sequence
CAGCACTGCT CAGACTCAGT GTTCACTGAT GAAGATTAAT AATAGAGTTA TTCATGTGTT 60
CAAGAGTTTC CTCGTCTAGC TGAAGCCGTT TAAAACGCCT GATGTGCACA TTAATTCAGC 120
ATAATGGATT AAGGGACAGT TAAACTCATC ATTCACCTTC CCTCCGCCCG TCTCAAACCC 180
TGAACAGTTC ATTTCTCCTG CTGAACACAG AAGAAGATAT TTTGAAGAAT GTTGGAGGCC 240
TGTAACCATT GAGCAATGCT GTAACCTTTG ACCTCTACAG TATTTGTGTG TCCTACTGTA 300
GAAATGATGG TTACAGGATT GAAGATTTCC TCTAAATATC TTCTCTTACA GGTTTGAAAA 360
CTATTGAGGA GTAAATGACG CGTGTAAACC TTCATTTCTG ACTATCGCTG TCATGTTGAC 420
CTGCACTATT GTGTCTGATA TTAAAGCTGA CGGATTATCT TTATTATTAG ACACAGATGA 480
AGCCTGAATA TGACACATTT CTGCATTGGA AACCTTCATC AGGAAAAGCT TCATGTTTAG 540
ATGATATTCA GTTCATATTC TGAGTGTTAC CGCGCATCAA TAATCAGCAG AACTGATCCT 600
GTAATAAAGT CCATCAGTAG CTCAGACTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTGCGC 660
GTCTCCACCT CAGTGTGTTA AATCTCCTTC ACTCATCAGT GTTTATTACA CACACAAACA 720
GAAACTCTGC GTCGCGCGCG CGTTTGAATT AGGAGACGCG ACAGCGCTTT GGAGACGCGT 780
CTGTAAAAGT TGAAATGACG CTTATAAAGC GCACATGTGG AGCTCGGGAA CGCGACGCTG 840
TGAACTTCTG CACATTCTCT ATCATTTGAC GCGTCAGATT CAGACGCGAC GCAGCGGCTG 900
TGATTTCTGC TCAGTTTAGT TCAGTTTGTG CTCATTAATG AGTGAGGAGA TGAAGGTCAG 960
TGAAGCAGCA GCACTTTCAG CGCTCAGACG CTCGCTAGCG TGACGCGCGC GTAATGTTGA 1020
CGCACTGACC GGAGAGCCCG ACCGACGCGG CGACCTCCCT CCACGCCTTC ACCCTCCGCT 1080
CGGTGCTCCG GTAATCGTGC AGAGACACGT TGTACAGCAC CGGGAACGCG TACACCGTCT 1140
GGATTAATTT CTCTGACGCG GCCATTGACA TTATTGAGTT GCT 1183