EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-15999 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr4:60973184-60974402 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:60973355-60973376TCCTTGTTTCATTTTCATTTT+7.38
IRF3MA1418.1chr4:60973358-60973379TTGTTTCATTTTCATTTTTAC-6.02
ONECUT1MA0679.1chr4:60973401-60973415CATATCGATTTTCT-6.1
ONECUT2MA0756.1chr4:60973401-60973415CATATCGATTTTCT-6
Enhancer Sequence
TTCTTTACTA AATGAACAAT CAATATGCTT TCTAAAATCT CCCCATAACC TTTTTATAGA 60
ATTCTGGCAC TTTATTCATC ATATTCTCTT TGGGGTTCAT CCATAATATA TATTCTTGTA 120
TTTCCCCTCA TTTATTTAAA AAAATATCTT TATCTTCCTC CCACACTAAA TTCCTTGTTT 180
CATTTTCATT TTTACCAACC CTTATACCTA AAATTTTCAT ATCGATTTTC TCCTCTTTAA 240
ATTAGATTTT TTCTGGTAAA ACATTTATTT TTCCCATTCT CATGTATTTA GGATTCGATA 300
TGAGCAACAG GACCTTTGAT GCCAGCATAC TGTGTAGATA AGCATTGATC AAGTCACGCT 360
TCTAAGGCAT GGAAGGAATC TTTTCAATTG TTAAGTCTCC ATTCATTGCC ACAACTACAG 420
ATAGACCTTC TGCTGTTGTC ATCGATCTAT TTAATGTCTC CTACATGACA TGGAGTCCAA 480
ACTATTGTGT TGTACTGATG TCTACACCTA CAACAACCAT TAACCAAAAC CTCACAGTAA 540
ACTGTTGTGT TTTAGCAACA TCTACACCAA CCATAAACCT AAACCCCACC TCACGGTAAA 600
CTTTTGTGTG CCGTAAAGGT CTGCGCCGAC CACAACCCTA CACTTTGCCT GCTTGTAAAG 660
CCAAGCCATG GAGCCTGGAT AGCTCAGTCG GTAGAGCATC ACACTTTTAA TGTGAGGGTC 720
CAGGGTTCAA GTCCCTGTTT GGGCGTGTAA GGCTCTTTTT GTGGAGCCAC AGCTTATGCC 780
GTTGAGCTGT CGCTTGCCGA AAGATTTATC TACATGCACA ACAAGTGTAC TAGACAAGAG 840
GACATGGCAG GCCAAGCAGT CTTGTAGTCG TGGCCGAGTG GTTAAGGTGA TGGACTCGAA 900
ATCCATTGGG GTCTCCCCGC GCAGGTTCGA ACCCTGCCGA CTACGTCCAG GCAGTGCGCA 960
GGATTTAGTT TGCGACATTC CATGATTGTT TGTAACTCCA TTCTTTCTTG GGAAAAGGGT 1020
TGTGCTGGAA GGGAAAAGCA CCAAAGATAA AATGGCAGCG CATGCTAACT GACTGCTCTG 1080
GGGGCCTTCC ATTTTTAAAG ACATATGACA GAGAGTGAAG GGCCAGTGGC TTTCCCGTAG 1140
CTCGTCGTGA TCGTATAGTG GTTAGTACTC TGCGTTGTGG CCGCAGCAAC TCCGGGACAC 1200
GTCAGGTTTT TCAAGGTG 1218