EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-15919 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr4:53889818-53891206 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:53890640-53890651ATAATTAATAT-6.02
CTCFLMA1102.1chr4:53889882-53889896CAGCAGGGGGCAAC+6.22
NFKB1MA0105.4chr4:53889907-53889920TGGGGATCCCCCT-6
Enhancer Sequence
ACCTGCAATC TATTCCATTC ATAAAAATAG GTGGTTGCTG GACAGTAGAA TTTTGAGGTT 60
TTGACAGCAG GGGGCAACTC AGGGGGAGCT GGGGATCCCC CTTCAAAGGT TTTTTTGTGG 120
ATCTGTTAAA GTTTAACAAC TTGGGTGGAA AAATCATATA AAACATCCCA CGTTTAACTT 180
ATTTGACTGG GCCCAAATAG GCTGTTTGTG GACAGTGCTT TTTTGGGGTA CAGAAGCCTT 240
TTGGTGAGCT CTGAGGTGGA AAAAACTGTT GATTGGGGCC TCCTGACCCC TCTGCTCCCT 300
CTAATGAACC CCAAAACTGT TCCTGCTGTG AATGGTGACC TTTTACAGGG GTGTCCACAG 360
ACAGCCTACC TAGCCCTGGT TAAATAAGTT ACAGGTGGGA TGTTTTTTTT TGATCCATCA 420
GATAGAGTTG GAATATATAT ATATATATAT ATACAAATGT ATATATATAT ATACAAAATA 480
AAACAAACAA GACTTTCTCC AGAAGAAAAA ACTATCAGAC ACACTGTGAC AGTATCAGGC 540
AGAGATTATT TGCTCTTTTA AACATCATAT CTAATAACAC AGAGGTCAAT GCAAATTAGC 600
GCCCCCTATA ATGTTTGAAC CTGCTATGGT ACTGCAGATT TTAGCCATTT CGAACACATG 660
CAATATCCCC TTTTGTACAC TAGAGGGGGC AATTTAATCA ACATTTCCAG TGGGGGTTAT 720
TATCAGGGAT TTGTAACTGC ACAGATATGA TTCAATAAAG GACACTTACT GCATGGATGG 780
ATGGATGAAC AGACTATATA TATTTATATA ATTATAATTT ATATAATTAA TATCTATAAT 840
TTATAATGAA ATGTATATAA TTTATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 900
TATATAAATA AACACACATG TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 960
TATATATATT TATATACACA CACACACACG CACACACACA CTTATATATT TTTTATTTAT 1020
TTTTAAAATC TTTTTTATAA TATTTTTTAA TATTTTTTTT AAAACTACTT TTATTCTTTC 1080
CAAAATAAAA CAAACAAGAC TTTCTCCAGA AGAAAAAACT ATCAGACACA CTGTGACAGT 1140
ATCAGACAGA GATTATTTGC TCTGTTAAAC ATCATATCTA ATAACACAGA GGTCAATGCA 1200
AATTAGCGCC CCCTATAATG TTTGAAGCTG CTATGGTACT GCAGATTTTA GCCATTTCAA 1260
ACACATGCCA TATCCCCTTT TGTACACTAG AGGGGGCAAT TTAATCAACA TTTCCGGTGG 1320
GGGATAACAT CCCACGTGTA ACTTATTTGA CTGGGGCCAG ATAGGCTGTT TGTGGACAGT 1380
GCTTTTTT 1388