EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-15639 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr4:35882539-35884619 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:35883079-35883098TACCGACACCTGCTGGAAA-6.25
Foxq1MA0040.1chr4:35883209-35883220TATAAACAATA-6.32
ZNF263MA0528.1chr4:35884077-35884098TCCTCCTCTTTATTCTCCTCA-6.29
ZNF384MA1125.1chr4:35882781-35882793AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882874-35882886TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882875-35882887TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882876-35882888TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882877-35882889TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882878-35882890TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882879-35882891TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35884118-35884130AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
CTGGGTTTTG GAGTCACCAG TCTCTGTTTT CAGCTCATGT TTTGAATTGT CAAAGACATC 60
AAAATATTTG CAATATTTCA ACTCTTACAG GTTGAACTAA AATAATTCTT GCAAACTACA 120
TGATAAAGAC AAAATTATTT TTTTTTCCAG TGCCTCCTGA CATGCTGGTA ACAAACAAAA 180
CTGGCCTCGG TTTGATAGAG CACACAGGGC CGGAGTTTTG CACTAAGGCT GGCTTTAGAA 240
CCAAAAAAAA AAAACTAAAA GCGGTTTGTG TTGAGGTGGT TCATCATAAG ATCAACAATA 300
TATATAATAA TAATAATATG TATCACCTAT AGCAGTTTTT TTTTTTTTTT TTGTAATTTC 360
AAAGTATTTT CTTTAAAATG ACAATAAGAT ATTGCATTTA TTGTATTGTA TGTGGATCTG 420
GGGAGACTAC AAAATTAGGT AGGCAGAAAT ACATTTTTTG GCATGTTTCC TTCTTGCAGT 480
TGTAATAGAA TAACTCTTGC ATGTATTATT AAAAAAGAGA AATTTCGTTT TTTGTGTGTT 540
TACCGACACC TGCTGGAAAG AAATGAAATT GGTTCCAGGG TGCTGGAGCA CTCAAGGCCT 600
GAGTTACACA TTTTCAAACT TCAGTTTATA TAAAAAGCGA TTTTTTGTGT GTTTATTTTA 660
ACACAGACAA TATAAACAAT AATTGTACTT GTCAACAGTA TTAAATGTAA TTTTAAAGGG 720
TTTTCTTTAA AATGATACTA AACTTTTGTA TTTACTTCTA TGCATGGGGA AAACGGGACT 780
ATTCTCTTGC TTAAGTACAA ATGAATGATT TCTCTCTAGT GTGGGTTAAT ATGTGTAGAT 840
TAAGGGATGA TGATCGAGTG AAACTCTTCC CACACTGAGT GCATGTAAAT GGTTTCTCTC 900
CAGTGTGGAT CATCATGTGT TGATTAAGTT GTGATGATTG GTTGAAACTC TTCCCACATT 960
GAGTGCATGT GAATGGTTTC TCTCCAGTGT GGATCCTCAT GTGTCGAATA AGGTGTGATG 1020
AGCTTTTAAA ACTTTTCCCA CACTGAGTGC ATGTGAATGG TTTATTTCCG GTGTGGATCC 1080
TCATGTGTTG ATTAAGGGAT GATGATTGGC TGAAACTCTT CCCACACTGA GTGCATGTGA 1140
ATGGTGTCTC TCCAGTGTGG ATCCTCATGT GTAGATTAAA GTGTGATAAG CAGTTAAAAC 1200
TCTTCCCACA CTGACAGCAT GTGAATGGTT TCTCTCCAGT GTGGATCTTC ATGTGAATCT 1260
TAAGATTGCC TTTTCTTCCA AAACTCTTTC CACACTGAGT GCATGTGAAT GGTTTCTCTC 1320
CAGTGTGGAT CCTCATGTGT TGATTAAGTA GTGATGAGCT GTTAAAAGTC TTCCCACACT 1380
GAGTGCAAGT ATATGGTTTC CCTCCAGTGT GGATCCTCAT GTGTTTATTA AGGGATGATG 1440
ATCGGCTGAA ACATTTTCCA CACTGAGTGC AGGTGTCTCT CCTTTTCAAA ATACCATCAG 1500
TGTGTAAATG AGTTTTTTCC TCAATTTTGA CACTATGTTC CTCCTCTTTA TTCTCCTCAT 1560
TCTCTTCAAT TAGGTCTGAA ATAAAAAAAA ATAAAACATT AGTTTTCATT AAGTCTTTAA 1620
AACTCTCATC AAAAGCTGAA AAGTGAAAAG ACACTGGAAA CATTGGCTAC ACACTGTAAA 1680
TTTGATGCCC ATTAAATCTA AAATAAATCA GATCATATTT TGTTTGGTCC CTTGCACACA 1740
TTTAAGCAAA ATCAATTTAA TTATCTTTAT GTATCTAGTG CTTTTACAAT GTAAAGTGTG 1800
CCAAAGCCAC TTACCATAGA AGTTATAGTA AATTTAAACA GTGTCAGTCC AGTTTTCAGA 1860
GTTTCTTACA TAATTGATTA TAAAAGTCAT TTTGGTCATA TTGATAAGAC ACAGATTTGA 1920
AAAAAAAAAG AAAGAGGAAG AGAGTTGAAG TGGGCAGCAT TATGTGGTGT GTGGAAGAAA 1980
GAGAAGTTGA CTGAACTGTT GCAGTGCGGG GAAACAAGTA GAGAAACCGT GTCAAGATGA 2040
GCAGTGTAAA CTTAGGGCCT ACTCACACTA TGCCATCCGT 2080