EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-15575 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr4:31889481-31890602 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:31890453-31890470TGAGTTAATTAATTCGT+6.59
Alx1MA0854.1chr4:31890452-31890469GTGAGTTAATTAATTCG-7.1
Alx4MA0853.1chr4:31890452-31890469GTGAGTTAATTAATTCG-6.68
EOMESMA0800.1chr4:31890192-31890205AAGGTGTGATAAA+6.23
Foxq1MA0040.1chr4:31890438-31890449TATTGTTTATT+6.62
Lhx3MA0135.1chr4:31890455-31890468AGTTAATTAATTC-6.15
Enhancer Sequence
TTCCCCCCAC TTTTAGTTTG TGTGATTTTA GTCTAGGGTT GGGACAACAA TGTGTGTTTA 60
AGAAATGTTT AGTGTTGTTA TAAGAGTTAA ATAAAAATGC ACTAAATTTT CAGGAGTGAT 120
GTTTTGTATG ATTATTTATG TCAATGTATC TGCATTTAGA CATAAGATTT TTTAGAGGCA 180
GTCAAACAAA CATTAATAAA CTTTGTAGAA TAAATATTGA CTGTTGTTTA TTTATGTGAG 240
TTACAATCAT AGACCTGCAC ATTTTTAAGT AGATATAAAA ATATATGACT ATTAAAGTAC 300
AGTTACATTC ATTCTTTGTT GTAATAATAA CAGTACCTAA AAATAAAGAA TAAAAACTTT 360
TATTATACAG AATCCAGTTT AAAGAGCTTA GTTTTACCAG TTTGTTAGCA AAGCAATATT 420
TATGCAGTGT CACATCCGAG GAACTGAGTG TCTTTGAAAA TATTATGTGC AGTTTACAGT 480
TTAAGAATAA AAGCATATTT ATTTAAAATT TAGTTAGCAA AAATTGTATC AAACAAATTA 540
TTGTTTGGGC CTTAAATGGA AAAGTTTCTT TGGTCAGAGT TTCTTTTGTC AAAGTTTCTT 600
TGATCAGAGT TTCTTTTAGA TTAGGCAGGG TCCACAGCCC CACACCCCTG CTGTTTTGAA 660
ACTCAAACAC ATCAGTGTAA ATGGGGCCTG GGATTTTCAC AGATAAAACC AAAGGTGTGA 720
TAAAAGTGGT GTGCATCAAA CCCATTCCCA CACCTCTCCA ATTAAGCACA AAAACTTGAG 780
TTTGAATCAA ACAATGTCTT TGTAACTTTT CCATTCAAAT TGTGAATCCT GAATTACCCA 840
AATTCTTATT TTGTATAGTT TTAATGTCAA GGTATTTGCA TTTGGACATA AGATAAGTAT 900
TTATTTTCAA GAGCAGTTAA ACTAACATTA ATAAAGTTTG CAAATGAAAA TATTGATTAT 960
TGTTTATTCA TGTGAGTTAA TTAATTCGTT AATTTTAAGC AACTGTTTGG TAAACTGTTG 1020
TTGAAACATG TACAAAAGGA ATGTAAACCT GATTTTTTGG TCATTTGATA AATGCTTTGG 1080
GCATTTTTTT AAGTTGATAT ATATAATTTT ACTTTATTTC T 1121