EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14999 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr4:2193330-2193739 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:2193588-2193607CTCTGCCCTCTGCTGGTCA-7.18
LMX1BMA0703.2chr4:2193473-2193484TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr4:2193474-2193485TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:2193474-2193485TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:2193474-2193485TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:2193474-2193485TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
GACATTGACA ACGGCATAGC CCTGAACTCC ATTGTGTTAT ACATTATTAT TTTTTATTGT 60
TGTAATAAAC GCATTATGAG ATGTGAATAG AAATGCATTA GGCAATACAA TTTAAGTAAT 120
TTTTGCTATT TATGTTCAAG TATTTAATTA AATTAGGAAG TTATGGCAAC TTTAATGCAA 180
TAGTTTGCTA AATTGACCTC CGGCCTTTTT AAGAAAATGT TGCAGCTCTG CTTTAGGACA 240
AGGTGACTTT CTTTGACACT CTGCCCTCTG CTGGTCAAAT AATGTCGTTG CATGAGTCTC 300
TATAATTTTA AAATAGCGCC CTCATCTGCC CATTCACCTC TTATCTACAG CAACAGGTCA 360
AAGATGTGAT GTTCAGCTCT AAAACCAATA TAATAGAGAG ACGTGATTC 409