EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14694 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:45983292-45984438 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr3:45983432-45983443GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45983578-45983589GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45983724-45983735GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr3:45983322-45983332TAAAGGTCAC+6.02
SP1MA0079.4chr3:45983429-45983444CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45983575-45983590CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45983721-45983736CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP3MA0746.2chr3:45983431-45983444AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45983577-45983590AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45983723-45983736AGCCACGCCCCCA+6.34
SP4MA0685.1chr3:45983429-45983446CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45983575-45983592CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45983721-45983738CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP8MA0747.1chr3:45983432-45983444GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45983578-45983590GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45983724-45983736GCCACGCCCCCA+6.11
Enhancer Sequence
TCCCATTGCA GATCCCATTG ACTTACATTA TAAAGGTCAC ACATCTATAA CATTACATAG 60
GAGTGTCATA GAGACATGGG GGTGGGCTCA TCTGACTCAG ACAACCAATC AGCATCTCAA 120
TATGATAATG AAGCTCACAA GCCACGCCCC CAAACTGGTC CCATAGACTG CCATTATAAG 180
TGGCCTACAA GCATATCTTT GCTTAGCAGT GTCCTATTGG CTTGGGGGAT GGCTCATCTG 240
ACTCAGACAA CCAATGAGCA TCTCAATATG ATAATGAATC TCACAAGCCA CGCCCCCAAA 300
TTGATTCCAT AGACTGCCAT TATAACTGCC CTACATGCAT ATCTTTGCTT AGCAGTGTCC 360
GATTGACTTG GGGGATGGCT CATCTGACTC AGACAACCAA TGAGCATCTC GATATGATAA 420
TGAATCTCAC AAGCCACGCC CCCAAACTGG TCCCATAGAC TGCCATTATA ACTGCCCTAC 480
ATGCATATCT TTGCTTAGCA GTGTCCTATT GACTTGGGGG TTGGCTCATT TGACTTGGAC 540
AGCCAACCAC ATTCAAGTTC ACTCTGTAAC CTCGCCCATA GCAACAAAAG AGAGTACCCT 600
AGCAACCGTT CATCAACAGC TATATCTCAG CATCGGAACA TCGTAGAGAC TTGGGGATTG 660
GCTCGTTTGA CTCATGCTAG CAAACGGAAC TTCCTATATG CTACACATGC TAGCAGTGAC 720
TAGCTACATG CTAATATTGA CTAGCCAAGT ACTGTAACTT GCTAGAAATG CTTACTAAGT 780
GTAATTATTT CAACAGGCAT GTATGTTAGG CTTGCCTAGT AACCACCCAG GGTACCCTAG 840
CAACTGCCTA GCAACCACCC AAATTACCCT AGCAACCGCC TAGCAACCAC CTAGCAACCG 900
CCTAGTAACG CCTTAGTAAG GGCCTAGCGA CCACTCAGGA CACCCTAGCA ACCGCCTAGC 960
AACCGCCTAG CAACCACTCA GAACACCCTA GCAACCGCCT AGCAACACCT TAGCAACCAC 1020
CTAGCAACCA CTCAGGACAC CTTAGCAACT GCCTAGCAAC ACCTTAGCAA CCACCTAGCA 1080
ACCACTCAGA ACACCCTAGC AACCACCTAG CAACACCTTT GCAACCACCT AGCAACCACT 1140
CAGGAC 1146