EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14688 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:45950851-45952577 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr3:45951296-45951314AAGCCACGCCCCCAAATG+6
KLF14MA0740.1chr3:45951089-45951103AGCCACGCCCCCCC+6.35
KLF16MA0741.1chr3:45951090-45951101GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45951298-45951309GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45951444-45951455GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr3:45951188-45951198TAAAGGTCAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr3:45951102-45951115CAAACCACTTAAA+6.24
POU1F1MA0784.1chr3:45952305-45952319TATATGCTAATTAT+6.3
POU3F1MA0786.1chr3:45952306-45952318ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr3:45952306-45952318ATATGCTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr3:45952305-45952318TATATGCTAATTA+6.67
SP1MA0079.4chr3:45951295-45951310CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45951441-45951456CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45951087-45951102CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr3:45951297-45951310AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45951443-45951456AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45951089-45951102AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr3:45951295-45951312CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45951441-45951458CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45951087-45951104CAAGCCACGCCCCCCCA+7.45
SP8MA0747.1chr3:45951298-45951310GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45951444-45951456GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45951090-45951102GCCACGCCCCCC+6.44
Enhancer Sequence
CAGCCTAAGT GAGAACATAC CCCGAAAGCT GGTATAGGTC GCACCCCTGG GGCTCTAGGA 60
CGTCCCAAAG TGCTCCCCAT TGACTTTACA TTGCCCATTG ACTCCCATTC ATTACATTGA 120
CTCCCATTAT AAATGTCATA TGTCAATCAC AGTACGTGGC AGTGTCATAC TGACTTGGGG 180
GTTGTCTTAT TTGACTTAGG CAACCAATCA GCATCTCAAT ATGATATTTC AGCTCACAAG 240
CCACGCCCCC CCAAACCACT TAAAGACCCT TAATAACTGC CCCATAGACT TAACATGGGG 300
TGGGACGTCC CATTGCAGAT CCCATTGACT TCCATTATAA AGGTCACACA TCTATAACAT 360
TACATAGGAG TGTCATAGAG ACATGGGGGT GGGCTCATTT GACTCAGGCA ACCAATCAGC 420
ATCACTCTAT GATAATGAAG CTCACAAGCC ACGCCCCCAA ATGGGTCCCA TAGACTTCTA 480
TTATAATAGG GCTAGATGCA TATCTTTGCA TTGCAGTGTC ATATAGGCTT AGGGGTTGGC 540
TCATTGGACT CAGACAACCA ATGAGCTTTT CAATATGATA ATGAAGCTCA CAAGCCACGC 600
CCCCAAACTG GCCCCATAGA CTGCCATTGT AACTGGTCCA CATGCATATC TTTGCTTAGC 660
AGTGTCCTAT TGACTTGGGG GTTGGCTCAT TTGACTTGGA CAGCCAACCA CATTCAAGTT 720
CACTCTGTAA CCTCGCCCAT AGCAACAAAA GAGAGTACCC TAGCAACCAT TCATCAACAG 780
CTATATCTCA GCATCAGAAC ATCGTAGACA CTTGGGGATT GGCTCGTTTC ACCCATGCTA 840
GCAAACGGAA CTTCCTATAT GCTACACATG CTAGCAGTGA CTAGCTACAT GCTAATATTG 900
ACTAGCCAAG TACTGTAACT TGCTAGAAAT GCTTACTAAG TATAAATATT TCATCAGGCA 960
TGTATGTGAG GCTTGCCTAG TAACCACCCA GGGTACCCTA GCAACTGCCT AGCAACCACC 1020
CAAATTACCC TAGCAACCGC CTAGCAACCA CCTAGCAACT GCCTAGTAAC GCCTTAGTAA 1080
GGACCTAGCG ACCACTCAGG ACACCCTAGC AACCGCCTAG CAACGCCTTA GCAACCACTT 1140
AGAATACCCT AGCAACCACC TAGCAACGCC TTAGCAACCA CCTAGCAACC ACTCAGGGCA 1200
CCCTAGCACT GTTGCTAACA TGATGCTAGC AACTCGATTA GCATGTTGTT AGCATCATGC 1260
TAACACGATT AGCATAACGC TAGCTACATG CTAATCATGT TAGCATGATG CTAGCAACTC 1320
GATTAGCATG TTGTTAGCAT GATGCTAACA CGATTAGCAT CATGCTAGCT ACATGCTAAT 1380
CACATTAGCA TGATGCTAGC AAGTCGATTA GCATGTTGCT AGCATGATGC TAACACGATT 1440
AGCATTATGC TAGCTATATG CTAATTATGT TAGCATGATG CTAGCAACTC GATTAGCATG 1500
TTGTTAGCAT GATGCTAACA TGATTAGCAT CATGCTAGCT ACATGCTAAT CATATTAGCA 1560
TGATGCTAGC AAGTCGATTA GCATGTTGCT AGCATGATGC TAACACGATT AGCATCATGC 1620
TAGCTACATG CTAATCATGT TAGCATCATG CTAGCAACTC GATTAGCATG TTGTTCTATT 1680
GGCCAGTTTA GTACCGTTTT GTACCCCATC GATTTGCCAC GCAAAC 1726