EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14667 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:43006856-43008200 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr3:43007701-43007711TTTAATTAGG-6.02
LMX1BMA0703.2chr3:43007591-43007602GTTTTAATTAA+6.14
Enhancer Sequence
AGGATTTTTC TGTGTAGATT TTTGTCCCAG ATTTCCATCA TTGCCATCAG GTCTAGACAG 60
AAGCTCCACA GTCTCAGTTG TATATGACAT AAACTCTCTG CCACGGTTGA TTAAAGTAAA 120
GGCACGATTC AACAGCCTCC CCTGGCGGAT GCTGCTATTC ATACGCAACG AGAATAAGCA 180
ATCGAGGTGA GCTTTCAGCC TTTGGGAGTC CGAATCGTTT TAGTGAATCG ATTCACTCGG 240
ATAACTCACT GCAATGAACT AATTCTGAAC AAACTGACAC GTTATGCAAA TCCAATTGAA 300
AAAAATAAAC ACAAACTAAT CTTTAGTGGT CTGTGTAATC GCGTGAATGT CTCAAATATG 360
TGTAGCTCAT AATCACATTA CATCACACAT GAGATATTTG GTGTACATCA GATCCCGAAT 420
GGAGTCATCA TTATCGACTC TAATGAATCA ACCCTTTGCG AATTGGTTTG AACGACTCAT 480
TGAAAGGAAC CCGGAATCTT CTGGGCTAAA GAGGACACAA ATTACAAGTT GTATGTTTTT 540
AAGACACATT TAATACGACG AGTATCAAAA TAGTCCAAAA CGTAATAAGC CAGAAACGTA 600
ACTTAAACGG GAAACATCAA GTGGACATGA TTCTAGCTGA GGATAACAAT GTTTTGTATC 660
CCGCATCAGT CTTATATACT AAAACCAACG ACCCATTGTG CTAATAAAAA CCTAAACAAT 720
CATGGATAGC TGAGTGTTTT AATTAATAAT TACCCGAAAC CCCTATAAGC GGTTTGTGAT 780
GCGGGAATCA TTCGATGATT TATGAGTTTC CATCCGCTTT ACTTGACTCT TGTTGATGTC 840
AGGAATTTAA TTAGGGAAAC AATGTCCTCA CAGCGCAGGC GCGGTGGCCA AGTGGTAAGG 900
CGTCGGTCTC GTAAACCGAA GATCGCGGGT TCGAACCCCG TCCGTGCCTT TTAATCCACA 960
ACATTTCTAT AAAACATAAA ATGTGTGGAG GTAGTGAGCA ATATATGAAA ATCAACGTCA 1020
TGATGATCCA TCTGCTGGTT TACCTCACGA TCTTGTGAAC AACAATCAAA AAATGGTATG 1080
TACAAACAGG GGTTATGTTG AAGTTACTAA ATAAATTACA ATAAATCTCA TGGATCAACA 1140
GCCTACATGT GATTATCATT GCTCGACAAT AATGCAGTAA TGCGATTACC TCTACAAATT 1200
ATGACAATGC AAAGTTTGAA TCTCCTCAGC TATATGCTAA TGCTACAAAA AACAAACAAA 1260
ATTGACACAA AAATTACACT CAATGTATGT GTAAATAAAT CATGGCCACA AATTACAATT 1320
TTTGCTCTCT CGTTTAAGTA AATT 1344