EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14617 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:40409132-40410002 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD1MA1109.1chr3:40409322-40409335GAACAGATGGCAC+6.82
POU1F1MA0784.1chr3:40409663-40409677ATCATTAGCATATA-6.02
POU3F2MA0787.1chr3:40409664-40409676TCATTAGCATAT-6.27
Pou2f3MA0627.1chr3:40409662-40409678TATCATTAGCATATAA-6.24
Enhancer Sequence
AACTTATTCA TAATAGGTTA ACTGCGCTTA ATTTTATTAG TGAGAACAGC TATTGCTTTT 60
TACAGTGCAG ATTTTATTTT GGTGCAATAA TCACTAAAGA GACAATGGTC ATGAACCCTA 120
CAGATTGTTC TCTGATAGCA GTGTATGTGT GTTGGGCCAT CTGTGCCAGA TGTTAATGAA 180
ACATCACTCT GAACAGATGG CACACGTCTC CACATGTAAA AGATATGACA CTTGATAAGA 240
GACTCTGACT GGCATCAGAG TCAATGATAA TGCCATTTTC ATCCATGATA GCAAATTAAA 300
ACATCTCAAT GTGTTGAAGA CGGCTTCAGT AATTGAGGTC TTTTTAAATA CCATCTCCTT 360
GGAATCTCCT CTAGAGTCGA TACAATCTGG TCCTTAAATA TTGAGCTTAG TTTAATTTCT 420
AACAACTGGC CCACTATGTG GATAGAGAGA GAGAGCAAAC AGCTGGTTGT GAATGGTTTG 480
AAGAATTGGC CCCCCACATG AGAGCAGAAG CTCTTTGTTG GACCAGGGCA TATCATTAGC 540
ATATAAAATA CCTTATTTGC CCCGTGGAGA CAGTGAGCTG AGTGAGGACA AAGAGGGAGA 600
GAAGGCAGCT AGGATCTTCA GACTAGCCCA TGAAAGCTTT TCGGTAACAC CTAAGATAGC 660
AGATATATCA TTCATAATCT TAATTCACAG CATGGATGAC AGACTATGTG ACTTGAGGTT 720
ACGGATTTAA TATGCAGTAA AATAATTATA ATGTGTACAT ATTTAGATTT AAGCAAAGTC 780
TAACCTTTTG ACACACTTGA CAAGTGAGTT TCATATAAAT GCTGCTATTT TATAATTAAA 840
TTCAATTCAA TTCAAAATTG CTTTATTGGC 870