EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14559 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:37936478-37937402 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:37937002-37937021CTGCCAGCTGGTGGCGCTA+6.22
CTCFMA0139.1chr3:37936605-37936624CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr3:37936869-37936888TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr3:37936736-37936755TTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.79
CTCFMA0139.1chr3:37937309-37937328TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
DUX4MA0468.1chr3:37936666-37936677TAATTTAATCA+6.62
DUXAMA0884.1chr3:37936665-37936678GTAATTTAATCAA+6.74
IKZF1MA1508.1chr3:37937124-37937136ACTTCCTGTTCC-6.44
KLF14MA0740.1chr3:37937169-37937183GGACACGCCCCTCT+6.17
Enhancer Sequence
GGGACCTCGC ACCCGGGCTC ACCGCCGCTC GGTGGCCCCA GGATGACAGA GAGCAGCGAA 60
CAACATTATT TTAAGTCGAT ATATATAAAG AACCTGAGAA AATCACAGAT TTATGCCAAA 120
CTTCCTCCTG TCAGCAGGTG GCGCTATGAC TGTGACTAAA TATTGTCATG TAGATGTCTT 180
CAGAAGAGTA ATTTAATCAA TCATGTGAAG TTTCAGGCAG ATCGGACATT GTGTGGCTGA 240
GTTATAATTA GTTTCCTGTT GCCAGCAGGT GGCGCTATGA CTGTGACTTG ATATTGGCAT 300
GTAGATGTCT TCAGAAGATG AGTTTAATCA ACCATGTGAA TTTTCAGGAT GGCCAGACAT 360
TGTGTGGCTG AGTTATAAGC CAAACTTATT GTTGTCAGCA GGTGGCGCTA TGACTGTGAC 420
TCAATATTGC AATGTAGATG TCTTCAGGAG AGGAATTTAA TCAACCATGT AAAGTTTCAG 480
GCAGACTAGA CATTGTGTGG CCGACTTATA AGCCAAACTA CCTTCTGCCA GCTGGTGGCG 540
CTATGACTGT GACTCAACAT TGGCAAGTAG ATGTGTTAAG GAGAGGAATT TGATCAACCA 600
TGTGAAGTTT CAGGCTGATC CGACATTGTG TGGTTGAGTT ATAAGGACTT CCTGTTCCAT 660
GGCGAATCGT TGAGGTTTGT CATGCCGCCA CGGACACGCC CCTCTGCAAA AACTCTAGAT 720
CTTCACAATA TATCATCGCT AGAGCTTTCA GAGGACACCA CCCAAATTTG GTTCTCATAC 780
GATAAAATTT GTTGAAAGAG TTTGTCACAG TGTAAAACAT GTCATTTCCT GTGGCCAGCA 840
GGTGGCGCTA TAACTGTATC TGGATATTGG CATGTAAACG TGTTCAGGTC AGGACTCTTA 900
TTAAACGTGT GAATTTTGAG GCAG 924