EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14266 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:23604151-23605455 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr3:23605087-23605097GTTTTATTGC-6.02
NEUROD2MA0668.1chr3:23604303-23604313ACCATATGGC-6.02
SOX10MA0442.2chr3:23604991-23605002TTCTTTGTTTT-6.62
Sox3MA0514.1chr3:23604804-23604814AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
TACAACGCTT TTTCTATCTA TCGGAATTTG ACATCGTTCG CTTAAAATGA AAAAAGGAGA 60
CAATAATCGT GTTGGATGTC GACAGGAAAG GGAACAATTA TCGGAATGAG GTTGACCGTG 120
TTCGCCCTTG CCGAAGCCTG CAGGTTGCAA TAACCATATG GCCCATGTGT TGGCCCCGTA 180
GCCGTGCAGT ACCCTATTGG ACAAACGAAC CCCGTTGGCT TCTCCACCCT GTGTGTCCTG 240
TCAGTCCACT GGTTCACTAG TTCACCGTGT CAATCCACCC TGCTCCGCTC AAGCAGCGAG 300
AGACGATCAG ACAGCTTGAG GCTAGAGGTG GAATCTTTCG CCTGCTGGTG AGTGGTGCTC 360
CAGAGCAGTC ACACGCTAAG ACTCAGAGCC TGAAGTTCGG CTGAAGGAAA AGCGCCGAGC 420
TCCCGGAGCA TTGTGGTTGT GTACGCCTGT GTGGAATGTG CGCGCATTAA CAGTTCCCAG 480
CGCGCTCATG AACGCTGTGA TCCACAAGGT AGCTTAATTT TATGGTTTTG TGTAAACCAT 540
TGAATCGATA AGGAAGCTAT AAAAAGTTAC CTTTTCGCAT CGATCAACAA TTTATAAATC 600
TATAAAACAA TCCTTTCAGG GTTCAGTTCC GTCGTTTTGC AAAAGTATTC CAAAAAACAA 660
AGGCCCATCT TCGACGGAGA AACCGGGAGG AATGCTGGAT GTCAGGTAAG ATTTGCAAGC 720
TTCGAATGAT GCCGCATGCC TGGACTCTTC CTTGTGTCCC GAGCTCTTCT GCCGACAAGT 780
CATTAATTAT CCGTTGTGTG ACCTAGTCAT CCCTGGGTGT GCCCGATTTC GAAAACTTTT 840
TTCTTTGTTT TCAAACAACT GAAGATACTT GCTTTCAAAT TGGTAACCAA CGAGGACTAA 900
AAAGCTGTCT CATTCCACGC ATAGCTAACC TCATTTGTTT TATTGCTGTA TTATACTGTT 960
TTTAACTGAC GTTACTCCTC ATAAGATTAT TCACCAGTTA GCCTAATTTC TCAAATAGCC 1020
TACTCACTAA CGTTAGTTGG AAAAGTGTGG AGATTCGCGC AGAGGTCTGA AAGTGTAAAA 1080
AGACAGATTT ATGACCCAAA CAGACAGACT GCTTATTCTA CTAACAGCTC CTAATTTCAG 1140
CCTTTGCTTT GCTCTCCACT GAAAGCGCCA CAGGTATCAC AAAATGGGCT TATGGCCATT 1200
TAGTCTTGTT GTTATTTTTC AATTTTGCAG CTTGTAAAAC GACTGGTGTC CCTAAAACCT 1260
ACAGTAGGCG CAAGCTGTCA AATGTAATAG AGGAGCGGCT AATA 1304