EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14260 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:23586710-23588569 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:23587915-23587929AATGTTTACCTTGG-6.05
HAND2MA1492.1chr3:23587773-23587783TGCAGGTGTT-6.02
Hmx2MA0897.1chr3:23586750-23586767ACAAACAATTAACGAAC+6.19
Hmx3MA0898.1chr3:23586750-23586767ACAAACAATTAACGAAC+6.27
MAXMA0058.3chr3:23587794-23587804ACCACGTGCT+6.02
MXI1MA1108.1chr3:23587792-23587805GGACCACGTGCTC+6.64
POU1F1MA0784.1chr3:23587744-23587758TTCATTTGCATATC-6.22
POU2F2MA0507.1chr3:23587744-23587757TTCATTTGCATAT+7.82
POU3F1MA0786.1chr3:23587745-23587757TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr3:23587745-23587757TCATTTGCATAT-6.37
POU5F1MA1115.1chr3:23587746-23587757CATTTGCATAT-6.32
Enhancer Sequence
AGAAGAAATT ATTACAAAAA ATATTTGTCT ATTTTATTTA ACAAACAATT AACGAACTGC 60
GCCGATGCAA AACGACATGT TTAAAAGAGT ACACAAGCAG CCGTTTCATA GTTTGGATTT 120
TTAGATGCAC GCTGCTCATC TTTAGTGTTC TGAATACAAC CAGGGAAAAA GAACTGCTCA 180
ATGGCTGAAC TGATTTGTGG GTTATAAAGC CTTTTTGAAT GACCCCCTTC TCGAGCCATT 240
TTTCTTCAAA GTAATGACCT GGGTACAATT CAATATGAGC CAGCAAACTA TGCATGCATT 300
ACTATAGAAC TTTAGAGTGG GAGAGACCCA GAGTAGGGGT GAACCGGAGG TCAGTGCGTC 360
TAACAAATAT TAAAATGTAC TGGGACTCGT GACACGCCTC GCTGTTTAAC AAAGACTGCC 420
AAAGTGCGAG ATTAATATGA AAACTTGAGA GTCCACAACA AAATGCCTTG TATCGCCCAA 480
TGGTATTGTA GAGCTCACAG CGGCTTGAGG CTAACGTGCA TTTTATTTTT AGTTGTTTTG 540
GGACAGAGAA GGCTGCGTTA TATGGGGAAA GCCCCCTCTT CTAGCCAGCA AGATAACAGA 600
AACAGAAAAC AGAAAATACG GCGCGATGAC TCCTGCGGTC GAAGCTGGTG GCTCAGTGTT 660
TTTCCTTATT ATTTCTTTTT ATGAGCTCTT GTGTCGGCTG AAGATTTTCT TGGATGTCCT 720
AATGTCCGCC TATCTGTTAT CGTCGCGTGA TGTTAAAGAG GAGTACCAGG GGACCCACGG 780
CAATGAGAGG GAGTTGAACA CACAAAGGTA TCACGGCGAG GTCACGGGCT AAACCTGTGG 840
CTTTGGAGAA AGGAGTGAGG GGGGGTTCAG ACGGAGGGAC TCGCAGGAAC GGTTGAAACG 900
CAAAGAAAGG CTTTGGAGCG ACGACAATCA CCTACAAAGA CCGCGTACCG CAAATGAGAC 960
GAGATATGGG CGAGAGAATA CAGAAATGCG AGGTGCAACG CACAGAGTAA AAAAGTAAGT 1020
AAAGAAAAAG GCGCTTCATT TGCATATCGC CGTGCTCTCT TCTTGCAGGT GTTTGCTTGG 1080
GCGGACCACG TGCTCGCGCA CACTGTGGCG AGAGTACGGG TCCCCCCTCC TATCATAACG 1140
GAGTTATGAC TTTGAATTCG AGCCCCAAGG AGTTGCACTG TTGCGTGTGT GGGTTTTATA 1200
TGGTGAATGT TTACCTTGGC TATAGTCTCT GAACCGCGGC TTTCAATGCC TGTCGGTGTA 1260
CACATTAACC CCATAATGAG GCAGATGGCT CGAGGTCCCT ATGGCTTTTA CAAGGAGAAG 1320
GCTTACGGAG GTGAAGGCGA GGTCGGGGAC TTCAGGGGGT TAAAGGGTTA GATTGGACAC 1380
CAAGGCTCAA CTTTCTCCTA TTCTGTTAAA AAGTTTTGCT CCGCTAAAAT GTGAAATAAG 1440
GTGTATAGTT TTGAAGTAAG GCTAAAAAAT CTAATCGTTA AACTATTAGC CGTTCTATGT 1500
TTAACTGTTT CAGAGCAAGA GATCTGGAAA GAATGATACC AAGCAACAAT CAAAATGAAT 1560
GAGAAAAAAG AATAAGGCAA GCTGGAAAAA AAAGAAAATG GCAAAGGCCT GTTTGAAAAA 1620
TTGCTAGAGC TTTGACTGCC AAACGCTAGG GGTGCTACAG ATTTCTTTGA TATAAGAAAT 1680
TATATGCACA TCACATTTAA ACTGCTCAAT GAAAAAAATA CGTTAAATAA TCTTTCGATA 1740
GTATCAATTA TTATTTTGAT TCTAACATTA CAAGAATTAT TACATAAGCT TTATCTTTCT 1800
TTTGAAAGTT TATCTTGCAT TATTTTTTCC GCCTTCTTTG TCCTTAAACC GCAGCAGAA 1859