EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14259 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:23583278-23584656 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:23584526-23584541ATTGTTTATTTTGTA-6.28
Foxq1MA0040.1chr3:23584525-23584536AATTGTTTATT+6.02
HOXD9MA0913.2chr3:23584288-23584298GTTTTATTGC-6.02
Hmx2MA0897.1chr3:23584518-23584535ACTATTTAATTGTTTAT-6.24
Hmx3MA0898.1chr3:23584518-23584535ACTATTTAATTGTTTAT-6.07
RarbMA0857.1chr3:23583990-23584006AGGGGTCAAAAGTTTA+6.26
RargMA0859.1chr3:23583991-23584007GGGGTCAAAAGTTTAC+6.52
Enhancer Sequence
ATTTACATTT GCAATAACTT AACAACAAAG TTATTACAAT CATAAAACAG GATTAAGAGC 60
AACAGTGAAA TACTTCTGTG TTAGCGATTG GGAATCACAA TTAACATTTT GCATTAAAAT 120
TTAAGGCATA ATTTTGCTAT ACACATTGTC AGATGATTTA TATATAATTG TATTTATTGT 180
TGTCAAAATT AATCTATCAG ACGTTTTTTT TCTTTCAAGT AATTCTATTA GCAGTTTGTC 240
CTAAATACAA ATACATTCAG GCTGTTTTCT CCTCCCTACT TCGTTTGACG TTTTCCCCCC 300
TCAGATGTAA CTCTCCTCAG TCGCCAGCAG AGCCCGCTTT AGACCAAGAT CATGATGATT 360
GAGGTTGCTT AGTTTTTGCT GGACGCCGTG TTTGCACAAA AGAATTAGCT CTAGAATATG 420
TTATTTTAAT TGAGAACACA ATACTATCCT AAATTCCACC ATATATACGT TGTAGTACTG 480
TCCCCTGTGA TGTAAACCAC CCTCAAAGGA TACAAAATGT GCCTGTGGAC ATTACATAAT 540
GAGATAACAT AGTTCAATGC ATTTGTAGGC AATAAGACAG CATCAAGATA TGGCTTAGGT 600
AAAATAGAGG CTCGTTTCCC CTCTCTGTGT CCCTAGTTTA ATCCAGAGTA GCGTGGAGGT 660
GAGCCGTAGT CTCGTTAGAA GTGGCGCGAG ATTTGGCGGG GTTAAAAGGT TTAGGGGTCA 720
AAAGTTTACG TAGTGCGTGA CTCGGTCGTT GGCTGTCGAC TCGCTGCGCT TGACCAATCG 780
CTGGATGTCA ATGGCAAAGT GGGAGAAAGA GAGAGAGGCG GAGTGAAGGT TTTAAACTGT 840
CTCTTTTGAA AAGATTAGAA AAATGACAGA AAGAGCAGTA CTGACTTTGC AACAAAGCAC 900
GTTGCTGAAA GGGTGTGTAG TGGAGAAAAA AAAACTATTG ATTCAGGAGG GCATCTGCGA 960
AAAGGCCTGG TGTTGCACTG TTGGTTTAAA AATAGTTCGT TTAATTCTGC GTTTTATTGC 1020
ATTTACTGCT TATACTTTTG TGAGGCGGGC TATGAATGTT ACATATAAAG CAAGTGAAAG 1080
GCAAATATAA CCAAACGTTT GATCAGTGTT CTATAGAAAT GTGATTCCGG TCGTTGTAAG 1140
TCATAGTAAA ATCATGGCAG CTATCATGAC AGTTACCTGG TAAAACTAAA GTCTGTTGCT 1200
TTTATTAATT TTATTGTGCT GTTTTCTACA GAAATGCTAC ACTATTTAAT TGTTTATTTT 1260
GTATGCTACT TTATTACTAT CTCTGTGTTG TTGGTCTAGG ATTGTGTAAA CCTATACATT 1320
TGTCTCAACA AAATAGCCAA TGCAGCTGCA AAAATATACA ACTGCAACCG CATAAATA 1378