EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14232 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:23385102-23387220 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:23385668-23385685ATCAATTAATTAATTAA+6.2
ArxMA0874.1chr3:23385669-23385686TCAATTAATTAATTAAG-6.66
DMRT3MA0610.1chr3:23385581-23385592AATGTATCAAA+6.02
DMRTA2MA1478.1chr3:23385581-23385593AATGTATCAAAT-6.04
DMRTA2MA1478.1chr3:23385525-23385537AATGTAACATTT-6.52
DMRTC2MA1479.1chr3:23385581-23385593AATGTATCAAAT-6.74
FOXP2MA0593.1chr3:23386646-23386657TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr3:23386643-23386660CCCTTTGTTTACTTGTC-6.03
Foxq1MA0040.1chr3:23386176-23386187CATTGTTTATT+6.02
Hmx3MA0898.1chr3:23385665-23385682TCAATCAATTAATTAAT+6.45
Lhx3MA0135.1chr3:23385671-23385684AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:23385672-23385682ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23385672-23385682ATTAATTAAT-6.02
TCF3MA0522.2chr3:23385720-23385730AACACCTGCT+6.02
ZNF384MA1125.1chr3:23386403-23386415TCAAAAAAAAAA+6.11
ZNF384MA1125.1chr3:23386401-23386413TATCAAAAAAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr3:23386405-23386417AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23386406-23386418AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23386407-23386419AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
CACAGAAACA CCAACTTACC CAGCCGGGAC TCGTTCCAGT AATTTTCTTG TGAGGTGACA 60
GTGAACCATG TTGCTTTAAG TTTAATTAAA TGTAAACAGT TGTCACAAAT TAGGGCAGCG 120
CGGTGGCGCA GTGCGTATGG CTGTCGCCTC ACAGCAAAAA GGTCACTGGT TCAAGCCTGA 180
GCTAGGTTAG TTGGCATTTC TGTGTGGAGC TTGCTTGTTC TCTCCGTGTT GCCATGGGTT 240
TTCTCCAGAT GCTTCGGTTT CCCCCACAGT CCAAAGATAT TAAATCCAGT AATGGATTGC 300
AGCTGGAAGG GTATCTGCCG GCGCTGCATA AAACATTTGC TGGATAGGTT GGGGTTCATA 360
CCGCTGTGTA CTAAAGGGAC TTTGCTGAAA AGAAAATTAA TGAATGTCAC AAAATTATTC 420
CAAAATGTAA CATTTATTTT TTGTAACTTT TACAATTACA CTGTAAAACC CAACAGTCAA 480
ATGTATCAAA TTAAATGAAG TAACTCAATT TACTGGAAGT TATTTCTAGT CATTTGAAAT 540
GAGTTTTGAA CTCTGAGTTG AAGTCAATCA ATTAATTAAT TAAGTAATCA AGTAAGTATT 600
GATTAAGCAT TAATGATGAA CACCTGCTGT TAGCAAGCAG AATTACTGAA GAGAAACGCA 660
AAACTAAAGC TGACTTCAGT CACAGCCTTA ACAGAAATGA AACACATTCA GTCTCTTAAA 720
ATCTTAACAG AGGATCATTA AACAACTAAA CAAACAGTAT CAACAGCTTT ACTTATTACT 780
AACCTGCTGG GCTTTGTTTC TGTCGAACAT CTACAAAAGC CTTTTGCAAG ATTTACTGAA 840
AAAATGATTC TTGATGTCTG TGTGTTTAAG ATGGTTCAGA TGTTCAATGT ATTTCAAACT 900
CTGCTGGGTT ACCTTCAGTA CGACAGCAGG TGGATTATTT TCAGCAATGT GAAAAGCAGC 960
ACCACAGCAT TATAATCTAA AGTGAAGGAA AACATACACT ATTGAAAAAC TGGATAACAC 1020
CATCATGAAA TGCAGTTGAA GTCAGAATTG TTAGCCCCCC TGAATCATTA GCCCCATTGT 1080
TTATTTTTCC CCCCAATTTG TGTTTAAGGG AGAGAAGATT TTTTTGACAC ATTTCTAAAC 1140
CTAATAGTTG GAATAACTTA TTTATAATAA CTGATTAAAA CACTTAAGAC ACTTCTATAC 1200
AGCTTAAAGT GACATTTAAA GGCTTAACTA GGTTAATTAG GTTAACTAGG TTAGGGAAAT 1260
TAGGCAAGTT ATTGTATAAC AGTGGTTTGT TCTGTAGAAT ATCAAAAAAA AAAAAAACTT 1320
AAAGGGGATA TTAATTTTGT CCCTAAAATG GTCGTTAAAA ACTTAAAAAC TGCTTTTATT 1380
CTTGCCAAAA TAAAACAAAT AAGACTTTCT TCAGAAGAAA AAAACATTAT CAGACATGTT 1440
GTGAAAAATT TCCTTGCTCT GTTAAACATC CTTTGGTAAA TATTTAAAAA AGAAAAAAAT 1500
TCAAAGGGGG GCTAATAATT CTGACTTCAA CTAATTTTTT CCCCTTTGTT TACTTGTCAT 1560
AACACACAGT TACAAACGCC AAAGAAAAAC AAACATGAGG AAGTCAAAGG GCCCAATTAA 1620
GCACACACTG TTCACATCAG TGGCAATGTG TAAGAAAATT TATATTTTTA GATAATTTCA 1680
GAAGACATTC ATTTGTGGAG TTCTTAATGA ATCTCTGCTG AAATGTTGAG AGATTGAATG 1740
CGTTTCATTT CTTTTAAGGC TGTGACTAAA GTCAGCTTTA TGTTTGTTTC TTTCTTTAGT 1800
TATTCTGCTT GTTAACAGCA GGTTTTCATC ATTGATGTTC AATCAACTAA CTAAGTAGTT 1860
TAACGTAAAT GGAGGAAGTT CACAGTACTC GTATAGATTA GTTTTTGGAC TGAAATGGTT 1920
TGTAGCAATT GGTTCCCTCA AACGGTTCGA GTTGCCTAAC TTATTGGGTT TTACAGTACT 1980
CAGTTGGTTT GAGTTCTCTT CATTTATTGG GTTTTACTGT ACTCAAATTG CTTTGTTTAC 2040
TCAAATAGAT TAAGTTCACA GTACTCATTG GAATTAGGTT TTTGAACTTA AATGGTTTGT 2100
TGCAATCGGT TTCCTAAT 2118