EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

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EnhancerAtlas ID
DR009-14126 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:15663292-15664474 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr3:15664114-15664125TATTGTTTATT+6.62
GSX1MA0892.1chr3:15664090-15664100CCTAATTAAA+6.02
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:15664366-15664381GCGAACTTTGAACCT-6.01
Hnf4aMA0114.3chr3:15664365-15664381AGCGAACTTTGAACCT-6.18
POU1F1MA0784.1chr3:15663569-15663583AATATGCTAATTAA+7.25
POU2F1MA0785.1chr3:15663569-15663581AATATGCTAATT+6.52
POU3F1MA0786.1chr3:15663570-15663582ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr3:15663570-15663582ATATGCTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr3:15663569-15663582AATATGCTAATTA+7.04
POU4F2MA0683.1chr3:15663575-15663591CTAATTAAATATGCAA-7.84
POU4F3MA0791.1chr3:15663575-15663591CTAATTAAATATGCAA-6.62
Pou2f3MA0627.1chr3:15663568-15663584TAATATGCTAATTAAA+6.43
Enhancer Sequence
GTACTTTAAC AATGTCAAGC TATCTAAAAA CATCTTCACA TTTGCAGTGC ATTTAAATGC 60
ATGTTTAAAT TGTACACGTG TGTGCATGAA TATATGTGTA TGTTTGTGTC TTATGCACTC 120
TATTTTTTGT TTTTCTGATT GCCTGAACAC TAACACTGGC CAATAGAGTC ACTCCTAACA 180
TGTTAATATT TTTTATCATA CTTGGGAACA ATTTATATCA TGTACTGTTA TTCACACACA 240
AATCTAAAAG CAATATATTG TTAATTAAGT AGTGTTTAAT ATGCTAATTA AATATGCAAT 300
ATACAAGGTG CTATAAGAGA TTATTTGTGA CCCTGGACCA CAAAACCAGG CATAAGAGTG 360
ACTTTCCTGA AGTTAATAAT CTAAGATCGC AATAAATAAG CTTTCCATTG GTGTATGGTT 420
TGTAATAGGA TAATATTTGG TCGAGATGCA ACCATTTTAA AATCTGAAAT AAAATTTAAA 480
AAAGTTCATT TATTCATTTT CTTTTTTGGC CATCACAGCG AAATGAACCG CCATCAGCAA 540
AGGTTTTAAG CAACGGATGT CCTTCCAGCC GCAACCCAGC ACTGGGAAAC ACCCAAAGAC 600
ACTCATTCAC ACACAATCAC ACATACTACG GCCAATTTAG TTTATTCAAT TCACCTATAG 660
GGTATGTGAG GGAAACCCAC ATCAACACAG GAAGAACATG CAAACTCAAC ACAGAAACAA 720
CAACTGGGCC AGCCGGGACT CGAACCAGCG ATCTTCTTAC TGTGAGGCGT CAGTGCTAAC 780
CACTGAGACA CTGTATCACC TAATTAAATA CTTAGCGATG CATATTGTTT ATTATATACT 840
TACTCGTCAC TATATTAAAG TCCATCATTT TGATCCATAC TGAGAGGTGT CTGGCTGCAG 900
ACTGTGTAGA TGCAACCTGA GCTGCATGCA AGGCTTTTTA ATAGCCCCAC CTAACCTCAT 960
CCCCAAATAA ACCTGTGCAA CATGGGACTG ATTTTGTGTC CAGGGTCACA ATTATTTGAG 1020
GAACTTCCAA TGGTTGGTCT TTACCATTGA GATATTTTAT GTACTGTATG TTAAGCGAAC 1080
TTTGAACCTG TCCTCTGTTT GCAGGATGTG CTGTAATGAT TTGAAGCGTT TGTCTTTGGT 1140
TGTGTGTTTG CAGGGGCGGA CTTAACCAAT AAGCGAGGTA AG 1182