EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14084 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:11060380-11061136 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr3:11060522-11060539TGACCCTTATGTTACCT-6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:11060522-11060539TGACCCTTATGTTACCT-6.26
ZIC1MA0696.1chr3:11060464-11060478AACAGCAGGGGGTA-6.24
Enhancer Sequence
AGTGATGAAG AAACCAACTG TTCCACTGTT CTATTCAAAT CACTGTTGAC AATGCAATCA 60
CAGGCTGGAG AAACAGAGCT ACTCAACAGC AGGGGGTAAT GCGAAGAAGT CCCCCTTCTC 120
CTTCCACTTA AACCCCCCTT CTTGACCCTT ATGTTACCTT CTGATTAGAG CACATTTCAC 180
ATAAAATGGT TAAGGTTTTA ATATGGTGTA TCTTGCATCA CTATATTCAT GTTTGGTATC 240
ATTTTAAATG TCTCTGTGTG ATTGGTAAAG TGGTCTTAAT TTTACAGTAA TATTTTACTG 300
GTATATGTTG ATTTGGTTTT TGACTTCTAT AAGATCTTGA TAAGATGCTC TCCCTCCTAA 360
GAGATGGTTA AGTCCTCAAA TTGACCAGGT CAGGGTTTCT GTGACACTTC TATTGTCTTG 420
AATTTATGGC TGTTTGTTTT GACTTGAGTA TATAAGGTAA GATGTGCTTT AGGACAGGGG 480
GGAGATCTTG TAAAAAGACA CCCCATTGCA GCATCTCTGA GACTTATGCT GCAATGTATT 540
TCTGTGGTCA GGTATGCATC TCTTAACTCT TTGATTTATC TTTGATAAAT GGATGTTGTA 600
TTGTTACAGT CTCATCTCTG AATTGGCTTC CTGATGATTT ATTATGTAAT TGGCAGAATA 660
CAATTTTACC TGACAAATAA AATTTTAAAT TTTGATTAAT TCTGGAGTTT TGCGAATTCA 720
TTGTATCCAG TAGATTATGT GGAGTCTCGT TACCCT 756