EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-14052 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:7619816-7621172 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:7621110-7621121TTAATTAATAT-6.62
CTCFMA0139.1chr3:7620656-7620675TACTGCCATCTAGAGGACA-6.43
FOXP1MA0481.2chr3:7620211-7620223AAGTAAACAGGA+6.07
Foxo1MA0480.1chr3:7620212-7620223AGTAAACAGGA-6.32
GRHL2MA1105.1chr3:7620848-7620863ACAAAACCAGTTTAA+6.25
Enhancer Sequence
AAGAGTTACC CATAATTTAA CACCTTTTTC CACAATTCTA CGGTTACCCA CATGAAAAAT 60
ACTACAGTAA CTTACAGTTA ATACTGTAGT GTTTTTGAAC TACACTATAA TAAAGTGTAT 120
TGTACAACTG TGTTATTGAA TGCGCAGCAG TAACTATGGT GAAATGAGAA AATGCTCTGC 180
ATACTGTAGT AAACATGAGT TTTTACTGCA GTAAACTGTG CTGTGTTGTA ATATAGTTGT 240
TGTAAATGTA GTACAGTGTT GGTGTTTTGT ATTTATACTA CACTATTTAC TATAAATGAC 300
TACAGTATTT GTCCATGAGG GTGAAATGAG TGAACACAGC ATTTCATTTG CCGCTAATAA 360
AGATCAGACA AATCCTGAAG TATAAGAATG TGTGAAAGTA AACAGGAATC ATAACCTGTG 420
CTTTTACCGC GAGAAGCTTT TACATCGAGA GCTTTAATAA AGAGGTTAGT GGCCAAAACC 480
AAGCAAAAAC AAAGCTGAAA ACCGACACTG AAGAGGAACA CAGCCGAGAG AAAAACACTT 540
GAATATTGAG AAAGTAGGAA TCTGAACTAA TAAATAAGGA GAGAAACACA ACGTTACCTG 600
TTTACATATG AACACGGTAA AAGTCCGCTA TTCCTGATCG CTTTCACAGA GGAATTGACA 660
GTCAAGAGCC AGGATATAAT GAAGAAAGGC AGGAGTTGTG TCGTGTTTGC TAAATAATCT 720
CTCTAGAGTT GATAAAAGCT GAAGTGTAGC CTCTTTGTTT CTTCTCATCT TCAACACGAG 780
TTTAATGTTG CTTGTTCTGA GCTTTTCCTC CAGCGCCTCC GCTATCAGTG TGCTGTGTAC 840
TACTGCCATC TAGAGGACAA TCACAGCAAC AGCGACTTAC AGCGGTCACC GGGCGCCAGG 900
AGGAAATCAG CTTCAGTCAA ATTAATAATT TCAGAATCAA TGTTCAGCAG ACAATAAATA 960
AATAAATAAA GAACCACCAA CAAAAAACAT TGAATACAAC TGCTTGTTTT AGTTCAACTC 1020
ATCATAGGAC AAACAAAACC AGTTTAATTG ACAGCAGACA CCACACATGA ACTAATACTA 1080
TAGTAAATAG TGAGCGGAGG GAAGCAGCAA GAGTTTCTAC TGCTCCACAC TCCATGTGTT 1140
TTGTATCCGG CTCACTCCAC ACTGTAGGTT AAACTTCGCT GTTGTCATTA CTAAAGAAAT 1200
TAAGTTAATA TAATTGACAT TACTTAAAAT ATCAAGTTTT GGCATCAAAA CCAAAACAGA 1260
AGTGTTTAAC TTACTCATTA GGCAGCAAAA ACCTTTAATT AATATTTTAA GTTCTCTAAA 1320
TTTCACATTT TAACTTGTTT AAATGATTCA CCACAC 1356